76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1380 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1380  PRC-barrel domain protein  100 
 
 		 173 aa  335  2.9999999999999997e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000425186  normal  0.828358 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10990  16S rRNA processing protein RimM  45.98 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000722638  unclonable  0.00000000154535 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00330  16S rRNA processing protein RimM  42.86 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000114022  hitchhiker  0.0000000000400055 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0690  16S rRNA-processing protein  36.99 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000088438  hitchhiker  0.000440701 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1329  16S rRNA processing protein RimM  29.14 
 
 		 173 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2874  16S rRNA processing protein RimM  29.31 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4173  16S rRNA-processing protein RimM  41.04 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0648  16S rRNA processing protein RimM  26.47 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1365  16S rRNA-processing protein RimM  28.4 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.887328 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1415  16S rRNA processing protein RimM  31.46 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000206982  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0036  16S rRNA processing protein RimM  28.99 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.181086  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2581  16S rRNA processing protein RimM  35.45 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00383976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1803  16S rRNA processing protein RimM  24.55 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000356142  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1300  16S rRNA processing protein RimM  29.17 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1698  16S rRNA-processing protein RimM  25.53 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0118  16S rRNA processing protein RimM  29.46 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18151  16S rRNA-processing protein RimM  25.75 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1943  16S rRNA processing protein RimM  40.16 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2189  16S rRNA-processing protein RimM  37.31 
 
 		 172 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0264003  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2051  16S rRNA processing protein RimM  27.27 
 
 		 167 aa  51.6  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2885  16S rRNA processing protein RimM  35.97 
 
 		 210 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17931  16S rRNA-processing protein RimM  23.57 
 
 		 179 aa  50.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1619  16S rRNA processing protein RimM  38.33 
 
 		 173 aa  50.8  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0182275  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04645  16S rRNA processing protein  36.76 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17981  16S rRNA-processing protein RimM  23.81 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.581865  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1307  16S rRNA-processing protein RimM  34.16 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2259  16S rRNA-processing protein RimM  35.04 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.133781  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0712  16S rRNA-processing protein RimM  29.57 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000237491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1385  16S rRNA processing protein RimM  31.03 
 
 		 197 aa  48.5  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.166858  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1196  16S rRNA-processing protein RimM  32.92 
 
 		 180 aa  48.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.934668 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0322  16S rRNA processing protein RimM  23.68 
 
 		 185 aa  47.8  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00023377  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1094  16S rRNA processing protein RimM  24.56 
 
 		 169 aa  47.4  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000169759  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0593  hypothetical protein  23.7 
 
 		 173 aa  47.8  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4970  16S rRNA processing protein RimM  32.48 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3307  16S rRNA processing protein RimM  29.24 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2144  16S rRNA processing protein RimM  29.38 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1096  16S rRNA processing protein RimM  33.91 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0393461  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0104  16S rRNA processing protein RimM  28.32 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1559  16S rRNA processing protein RimM  36.21 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0559633 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09770  16S rRNA processing protein RimM  37.72 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.098871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5924  16S rRNA processing protein RimM  37.84 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.144619  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2023  16S rRNA processing protein RimM  28.82 
 
 		 182 aa  45.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00335336  normal  0.0413859 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2222  16S rRNA processing protein  31.25 
 
 		 175 aa  45.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.646e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3680  16S rRNA processing protein RimM  38.26 
 
 		 211 aa  44.7  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.989233 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0130  16S rRNA-processing protein RimM  37 
 
 		 177 aa  44.7  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0512614  normal  0.0110832 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0787  16S rRNA-processing protein RimM  29.57 
 
 		 173 aa  44.3  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.0056e-16  unclonable  2.29437e-28 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0981  16S rRNA processing protein RimM  37.39 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613857  normal  0.277259 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26021  16S rRNA-processing protein RimM  33.83 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2183  16S rRNA processing protein RimM  33.58 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141383  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0226  16S rRNA processing protein RimM  41.07 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.652576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1091  16S rRNA-processing protein RimM  24.02 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000655231  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2221  16S rRNA-processing protein RimM  28.12 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000411195 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3758  16S rRNA processing protein RimM  27.13 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0504856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3753  16S rRNA-processing protein RimM  32.31 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1224  16S rRNA processing protein RimM  23.81 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135812  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2889  16S rRNA-processing protein RimM  33.04 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0164  16S rRNA processing protein RimM  25.27 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.199907  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1801  16S rRNA processing protein RimM  29.92 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1829  16S rRNA processing protein RimM  40.54 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1231  16S rRNA processing protein RimM  23.81 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000213348  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1186  16S rRNA processing protein RimM  31.29 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292134  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2307  16S rRNA processing protein RimM  32.14 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00013128  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11060  16S rRNA processing protein RimM  37.04 
 
 		 182 aa  42  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0760298  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0393  16S rRNA processing protein RimM  34.11 
 
 		 172 aa  42  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1984  16S rRNA-processing protein RimM  25.14 
 
 		 172 aa  42  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0664  16S rRNA-processing protein RimM  34.43 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.377331  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0987  16S rRNA processing protein RimM  29.5 
 
 		 184 aa  41.6  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000000842356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1947  16S rRNA-processing protein RimM  31.64 
 
 		 173 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2013  16S rRNA-processing protein RimM  31.64 
 
 		 173 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.325457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1967  16S rRNA-processing protein RimM  31.64 
 
 		 173 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0420461  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4207  16S rRNA-processing protein RimM  33.06 
 
 		 221 aa  41.2  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.408553  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1413  16S rRNA processing protein RimM  28.8 
 
 		 169 aa  41.2  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00447303  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0749  16S rRNA-processing protein RimM  35.29 
 
 		 220 aa  41.2  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2886  16S rRNA-processing protein RimM  31.09 
 
 		 199 aa  40.8  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0689866 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3592  16S rRNA-processing protein RimM  36.36 
 
 		 179 aa  40.8  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1091  16S rRNA-processing protein RimM  32.23 
 
 		 233 aa  40.8  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166922  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>