116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0593 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0593  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  347  4e-95  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2581  16S rRNA processing protein RimM  30.54 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00383976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04645  16S rRNA processing protein  27.98 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1385  16S rRNA processing protein RimM  26.19 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.166858  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0118  16S rRNA processing protein RimM  25.93 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1329  16S rRNA processing protein RimM  25.73 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0104  16S rRNA processing protein RimM  30.06 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1300  16S rRNA processing protein RimM  26.19 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0036  16S rRNA processing protein RimM  27.16 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.181086  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1462  16S rRNA-processing protein RimM  26.78 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2183  16S rRNA processing protein RimM  24.56 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2321  16S rRNA processing protein RimM  24.4 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1559  16S rRNA processing protein RimM  25.88 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0559633 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2018  16S rRNA processing protein RimM  25 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0112237  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0566  16S rRNA processing protein RimM  26.83 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00173533  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0847  16S rRNA processing protein RimM  25.6 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10990  16S rRNA processing protein RimM  27.78 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000722638  unclonable  0.00000000154535 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_505  16S rRNA processing protein RimM  28.05 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000191939  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3761  16S rRNA processing protein RimM  25.15 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000217474  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0712  16S rRNA-processing protein RimM  29.09 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000237491  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0848  16S rRNA processing protein RimM  27.54 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4068  16S rRNA-processing protein RimM  26.9 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.199941  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0659  16S rRNA processing protein RimM  23.26 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0110024  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1105  16S rRNA-processing protein RimM  25.4 
 
 		 193 aa  52  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3491  16S rRNA processing protein RimM  26.67 
 
 		 172 aa  52.4  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.92497e-30 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0551  16S rRNA-processing protein RimM  26.38 
 
 		 168 aa  51.6  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  2.44188e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1284  16S rRNA processing protein RimM  24.44 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.304592 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2999  16S rRNA processing protein RimM  23.21 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000783686  normal  0.831438 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3041  16S rRNA processing protein RimM  23.21 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000787897  normal  0.907916 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3940  16S rRNA-processing protein RimM  24.58 
 
 		 192 aa  51.6  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.519471 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1630  16S rRNA-processing protein RimM  26.38 
 
 		 168 aa  50.8  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000568977  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1016  16S rRNA processing protein RimM  26.22 
 
 		 169 aa  51.2  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000810353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1914  16S rRNA processing protein RimM  27.27 
 
 		 163 aa  50.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0767  16S rRNA-processing protein RimM  24.26 
 
 		 174 aa  50.8  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000495507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2222  16S rRNA processing protein  22.42 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.646e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4184  16S rRNA-processing protein RimM  22.67 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0124  putative 16S rRNA processing protein RimM  24.54 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.87226  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1632  16S rRNA processing protein RimM  25.75 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0946  16S rRNA-processing protein RimM  22.67 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.501365  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0950  16S rRNA-processing protein RimM  22.67 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1691  16S rRNA-processing protein RimM  26.23 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0591  16S rRNA-processing protein RimM  22.67 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1070  16S rRNA-processing protein RimM  22.67 
 
 		 225 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0584634  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2406  16S rRNA-processing protein RimM  24.85 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000189149  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2050  16S rRNA processing protein RimM  26.67 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.222222  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1298  16S rRNA-processing protein RimM  27.11 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1323  16S rRNA-processing protein RimM  27.11 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000721778  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1029  16S rRNA-processing protein RimM  22.67 
 
 		 225 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1965  16S rRNA processing protein RimM  27.27 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.863851  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3421  16S rRNA processing protein RimM  24.71 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0959961  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0428  16S rRNA processing protein RimM  25 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.709959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2052  16S rRNA processing protein RimM  26.32 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000163547  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0201  16S rRNA processing protein RimM  21.51 
 
 		 176 aa  48.1  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000521632  normal  0.064349 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1885  16S rRNA-processing protein RimM  22.65 
 
 		 191 aa  48.1  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0110154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2976  16S rRNA-processing protein RimM  26.01 
 
 		 248 aa  48.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.470421  normal  0.0518366 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3429  16S rRNA processing protein RimM  26.06 
 
 		 172 aa  48.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000572848  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1403  16S rRNA-processing protein RimM  23.5 
 
 		 187 aa  47.8  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2702  16S rRNA-processing protein RimM  23.73 
 
 		 190 aa  47.8  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.294971  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1380  PRC-barrel domain protein  23.7 
 
 		 173 aa  47.8  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000425186  normal  0.828358 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0518  16S rRNA processing protein RimM  21.79 
 
 		 188 aa  47  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.541026  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1365  16S rRNA-processing protein RimM  21.69 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.887328 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0805  16S rRNA-processing protein RimM  27.11 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000311839  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0226  16S rRNA processing protein RimM  20.61 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.652576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2374  16S rRNA processing protein RimM  25.64 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0803  16S rRNA processing protein RimM  26.06 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1007  16S rRNA-processing protein RimM  26.01 
 
 		 244 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2233  16S rRNA-processing protein RimM  22.67 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1068  16S rRNA-processing protein RimM  25.29 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.185683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0718  16S rRNA-processing protein RimM  26.28 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2854  16S rRNA processing protein RimM  25.79 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.77473  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1186  16S rRNA processing protein RimM  25.62 
 
 		 201 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292134  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0540  16S rRNA processing protein RimM  27.44 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000769846  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1199  16S rRNA processing protein RimM  24.71 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000995465  normal  0.109334 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2494  16S rRNA-processing protein RimM  26.06 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000966692  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2475  16S rRNA processing protein RimM  25.64 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10000  16S rRNA processing protein RimM  23.16 
 
 		 194 aa  45.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0953699  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3307  16S rRNA processing protein RimM  23.81 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1463  16S rRNA-processing protein RimM  25.6 
 
 		 178 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278393  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3354  16S rRNA-processing protein RimM  23.73 
 
 		 209 aa  45.1  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.305815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4258  16S rRNA-processing protein RimM  25.6 
 
 		 178 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5344  16S rRNA-processing protein RimM  22.29 
 
 		 189 aa  44.7  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0393  16S rRNA processing protein RimM  22.81 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2539  16S rRNA-processing protein RimM  23.53 
 
 		 221 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0648  16S rRNA processing protein RimM  30.46 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.144328  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1029  16S rRNA processing protein RimM  20.93 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.635977  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0678  16S rRNA processing protein RimM  27.32 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03479  16S rRNA-processing protein RimM  26.44 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0970  16S rRNA-processing protein RimM  26.51 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000015249  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3443  16S rRNA-processing protein RimM  23.64 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609284  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1682  16S rRNA-processing protein RimM  27.61 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00118486  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0682  16S rRNA-processing protein RimM  23.24 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0770  16S rRNA-processing protein RimM  23.84 
 
 		 231 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0324  16S rRNA processing protein RimM  23.76 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.884603 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2859  16S rRNA-processing protein RimM  27.91 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1514  16S rRNA-processing protein RimM  25.3 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.621384  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3980  16S rRNA-processing protein RimM  25.45 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000074804  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1710  16S rRNA-processing protein RimM  25.61 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000120991  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3134  16S rRNA processing protein RimM  26.47 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0103431  normal  0.109744 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2051  16S rRNA processing protein RimM  25.75 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3583  16S rRNA-processing protein RimM  25.45 
 
 		 171 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.00886e-22  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>