144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1012 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1012  putative integral membrane sensor protein  100 
 
 		 257 aa  505  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.158695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4875  PAS sensor protein  51.85 
 
 		 632 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.32 
 
 		 632 aa  163  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5416  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.26 
 
 		 632 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1466  putative integral membrane sensor protein  46.19 
 
 		 322 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4364  putative integral membrane sensor protein  46.19 
 
 		 273 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.04 
 
 		 627 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01755  putative two-component member protein  33.83 
 
 		 1111 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2146  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.79 
 
 		 709 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0988  putative integral membrane sensor protein  45.67 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.012877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0401  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with MHYT sensor  42.5 
 
 		 687 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.465852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0386  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.93 
 
 		 685 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5176  MHYT  39.44 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.15 
 
 		 766 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2427  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.59 
 
 		 683 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2190  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  45.27 
 
 		 695 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  37.68 
 
 		 1120 aa  116  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.62 
 
 		 766 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2249  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 		 1143 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.673162  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3702  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.88 
 
 		 692 aa  115  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.561666  normal  0.977889 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7110  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  45 
 
 		 694 aa  115  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0633557 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0510  hypothetical protein  44.16 
 
 		 701 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0522945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3581  GGDEF domain-containing protein  44.78 
 
 		 695 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49140  GGDEF domain protein  41.27 
 
 		 689 aa  115  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2333  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  44.78 
 
 		 695 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0328  putative integral membrane sensor protein  45.05 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3579  ggdef domain/eal domain protein  39.06 
 
 		 691 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42220  membrane sensor domain-containing protein  42.93 
 
 		 685 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3580  ggdef domain/eal domain protein  39.06 
 
 		 699 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3652  ggdef domain/eal domain protein  39.06 
 
 		 699 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.117514 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6267  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.18 
 
 		 693 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.57074  normal  0.863761 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3686  ggdef domain/eal domain-containing protein  39.06 
 
 		 699 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0580402 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3749  ggdef domain/eal domain-containing protein  38.42 
 
 		 699 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.338574 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1563  putative integral membrane sensor protein  43.18 
 
 		 367 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  40.2 
 
 		 627 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  40.2 
 
 		 627 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  40.2 
 
 		 627 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  40.2 
 
 		 627 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  40.2 
 
 		 627 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  40.2 
 
 		 627 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2525  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  44.67 
 
 		 693 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4460  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.15 
 
 		 709 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200253  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0743  sensor histidine kinase  39.7 
 
 		 627 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.93 
 
 		 689 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6743  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.37 
 
 		 693 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3579  hypothetical protein  41.41 
 
 		 685 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0227937  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1867  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.11 
 
 		 710 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.559225  normal  0.957058 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1144  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.3 
 
 		 686 aa  106  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.871944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2620  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and MHYT sensor(s)  38.06 
 
 		 799 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2057  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.24 
 
 		 774 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.906607  hitchhiker  0.00133985 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  37.93 
 
 		 626 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1690  putative integral membrane sensor protein  45.83 
 
 		 341 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0524  putative integral membrane sensor protein  37.6 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3110  putative integral membrane sensor protein  38.31 
 
 		 1141 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0940316 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.1 
 
 		 1121 aa  102  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0662  putative integral membrane sensor protein  36.87 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2102  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.11 
 
 		 689 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.762889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3335  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 		 1122 aa  99.4  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 1132 aa  97.8  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3675  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 966 aa  97.1  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1746  carbon monoxide dehydrogenase, coxC signalling protein  35.07 
 
 		 410 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7284  putative integral membrane sensor protein  40.21 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.609148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1490  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.38 
 
 		 724 aa  97.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.261971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 		 589 aa  96.3  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.75 
 
 		 594 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4735  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.21 
 
 		 689 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0595206  normal  0.234911 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.75 
 
 		 602 aa  95.1  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2798  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.12 
 
 		 695 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3716  putative integral membrane sensor protein  39.66 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.20203  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 611 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3232  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 		 1118 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 611 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0791  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 		 1118 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3194  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.67 
 
 		 726 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.178802  normal  0.0329837 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0834  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.82 
 
 		 831 aa  92.4  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.153138  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4067  putative integral membrane sensor protein  34.71 
 
 		 289 aa  92  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3694  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with MHYT sensor  35.94 
 
 		 678 aa  91.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.323415  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1661  putative integral membrane sensor protein  40.64 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.161452  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1434  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.93 
 
 		 716 aa  89.4  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.486546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2392  EAL/GGDEF domain-containing protein  37.37 
 
 		 688 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278752  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1182  GGDEF domain/EAL domain-containing protein  37.37 
 
 		 688 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1106  diguanylate cyclase/cyclic diguanylate phosphodiesterase  37.37 
 
 		 688 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.804569  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0664  EAL/GGDEF domain-containing protein  36.87 
 
 		 688 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0241577  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2508  putative PAS/PAC sensor protein  39.53 
 
 		 433 aa  85.9  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530113 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0802  EAL/GGDEF domain-containing protein  36.87 
 
 		 688 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1766  EAL/GGDEF domain-containing protein  36.87 
 
 		 688 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.356944  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0910  putative integral membrane sensor protein  34.36 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  39.39 
 
 		 611 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1252  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.2 
 
 		 760 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.849617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06202  Putative signal protein with GGDEF and EAL domains  37.19 
 
 		 696 aa  82.8  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.33406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00964  Putative signal protein with GGDEF and EAL domains  37.19 
 
 		 696 aa  82.8  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0651645  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1867  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.17 
 
 		 712 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.669974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4790  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36 
 
 		 807 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 		 1128 aa  80.9  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0185  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.52 
 
 		 713 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00871841 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4149  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.64 
 
 		 680 aa  79.7  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.498458 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25180  sensor domain protein  37.42 
 
 		 180 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0204  diguanylate cyclase  37.04 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.209858  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5273  putative integral membrane sensor protein  36.46 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.13 
 
 		 946 aa  76.3  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>