165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1431 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1431  16S rRNA processing protein RimM  100 
 
 		 176 aa  350  8e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0566865  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0678  16S rRNA processing protein RimM  65.34 
 
 		 176 aa  240  9e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1036  16S rRNA processing protein RimM  51.7 
 
 		 176 aa  171  5e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145928  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0559  16S rRNA processing protein RimM  45.45 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.970702  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0994  16S rRNA processing protein  53.12 
 
 		 158 aa  159  3e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0453  16S rRNA processing protein RimM  46.51 
 
 		 179 aa  154  8e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0735  16S rRNA processing protein RimM  46.86 
 
 		 179 aa  150  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.335769  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1294  16S rRNA processing protein RimM  46.86 
 
 		 179 aa  150  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0812  16S rRNA processing protein RimM  46.86 
 
 		 179 aa  148  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.335804  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1647  16S rRNA processing protein RimM  46.59 
 
 		 179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0787  16S rRNA-processing protein RimM  31.67 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.0056e-16  unclonable  2.29437e-28 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4068  16S rRNA-processing protein RimM  32.14 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.199941  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0365  16S rRNA processing protein RimM  28.65 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000438185  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2452  16S rRNA processing protein RimM  25.84 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000919836  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1091  16S rRNA-processing protein RimM  26.7 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000655231  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17291  16S rRNA-processing protein RimM  29.21 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1403  16S rRNA-processing protein RimM  27.22 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1293  16S rRNA processing protein RimM  25.16 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000894981  normal  0.803159 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3354  16S rRNA-processing protein RimM  28.16 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.305815 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1301  16S rRNA processing protein RimM  29.17 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0244939  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2702  16S rRNA-processing protein RimM  27.17 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.294971  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0847  16S rRNA processing protein RimM  25.9 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0803  16S rRNA processing protein RimM  26.06 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2885  16S rRNA processing protein RimM  22.35 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3665  16S rRNA-processing protein RimM  28.83 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000001599  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1302  16S rRNA-processing protein RimM  28.22 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000535622  unclonable  1.06066e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3941  16S rRNA-processing protein RimM  28.22 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000195727  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1535  16S rRNA processing protein RimM  26.59 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00265207  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2494  16S rRNA-processing protein RimM  25.71 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000966692  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2976  16S rRNA-processing protein RimM  29.12 
 
 		 248 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.470421  normal  0.0518366 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1298  16S rRNA-processing protein RimM  26.14 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1323  16S rRNA-processing protein RimM  26.14 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000721778  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4117  16S rRNA-processing protein RimM  29.28 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3102  16S rRNA-processing protein RimM  29.65 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000126118  normal  0.166795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1211  16S rRNA-processing protein RimM  29.65 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000458928  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1255  16S rRNA-processing protein RimM  29.65 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000416795  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1288  16S rRNA-processing protein RimM  29.65 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000110365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1007  16S rRNA-processing protein RimM  28.73 
 
 		 244 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1829  16S rRNA processing protein RimM  26.44 
 
 		 171 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0800  16S rRNA processing protein RimM  28.05 
 
 		 166 aa  52.4  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0383963  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09170  16S rRNA processing protein RimM  21.39 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11060  16S rRNA processing protein RimM  26.7 
 
 		 182 aa  51.6  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0760298  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1413  16S rRNA processing protein RimM  24.86 
 
 		 169 aa  51.6  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00447303  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0130  16S rRNA-processing protein RimM  27.33 
 
 		 177 aa  51.6  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0512614  normal  0.0110832 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1415  16S rRNA processing protein RimM  29.19 
 
 		 181 aa  51.6  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000206982  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1885  16S rRNA-processing protein RimM  25.56 
 
 		 191 aa  51.6  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0110154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0712  16S rRNA-processing protein RimM  27.87 
 
 		 169 aa  51.2  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000237491  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2052  16S rRNA processing protein RimM  25.29 
 
 		 169 aa  51.2  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000163547  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0201  16S rRNA processing protein RimM  22.65 
 
 		 176 aa  51.2  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000521632  normal  0.064349 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1386  16S rRNA-processing protein RimM  24.39 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3940  16S rRNA-processing protein RimM  25.56 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.519471 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2221  16S rRNA-processing protein RimM  23.43 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000411195 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4078  16S rRNA-processing protein RimM  28.73 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1016  16S rRNA processing protein RimM  26.7 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000810353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1632  16S rRNA processing protein RimM  29.71 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0770  16S rRNA-processing protein RimM  28.65 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2674  16S rRNA processing protein RimM  23.53 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109453  hitchhiker  0.000000299021 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1169  16S rRNA-processing protein RimM  27.91 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000549178  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3307  16S rRNA processing protein RimM  24.86 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10000  16S rRNA processing protein RimM  24.7 
 
 		 194 aa  48.9  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0953699  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2919  16S rRNA-processing protein RimM  28.49 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000569736  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0659  16S rRNA processing protein RimM  20.93 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0110024  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0650  16S rRNA-processing protein RimM  27.49 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.182958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4619  16S rRNA processing protein RimM  25.14 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3884  16S rRNA-processing protein RimM  24.54 
 
 		 171 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000398495  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3693  16S rRNA-processing protein RimM  24.54 
 
 		 171 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000284682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3583  16S rRNA-processing protein RimM  24.54 
 
 		 171 aa  48.5  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.00886e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0664  16S rRNA-processing protein RimM  23.12 
 
 		 170 aa  48.5  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.377331  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2539  16S rRNA-processing protein RimM  23.12 
 
 		 221 aa  48.5  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3980  16S rRNA-processing protein RimM  24.54 
 
 		 171 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000074804  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3890  16S rRNA-processing protein RimM  24.54 
 
 		 171 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000177338  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1803  16S rRNA processing protein RimM  26.29 
 
 		 178 aa  48.1  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000356142  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0226  16S rRNA processing protein RimM  25.29 
 
 		 170 aa  47.8  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.652576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0970  16S rRNA-processing protein RimM  28.74 
 
 		 169 aa  48.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000015249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1984  16S rRNA-processing protein RimM  23.3 
 
 		 172 aa  47.8  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0805  16S rRNA-processing protein RimM  24.16 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0344  16S rRNA-processing protein RimM  22.75 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2259  16S rRNA-processing protein RimM  26.18 
 
 		 182 aa  47.8  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.133781  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3882  16S rRNA-processing protein RimM  23.03 
 
 		 167 aa  47.8  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.13781  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5344  16S rRNA-processing protein RimM  22.7 
 
 		 189 aa  47.8  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0566  16S rRNA processing protein RimM  21.57 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00173533  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1091  16S rRNA-processing protein RimM  22.92 
 
 		 233 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1691  16S rRNA-processing protein RimM  25.14 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1462  16S rRNA-processing protein RimM  25 
 
 		 202 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0876  16S rRNA-processing protein RimM  23.6 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26021  16S rRNA-processing protein RimM  24.72 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0805  16S rRNA-processing protein RimM  23.86 
 
 		 167 aa  47  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000311839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3601  16S rRNA-processing protein RimM  24.54 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000401419  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07320  16S rRNA processing protein RimM  22.78 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000238844  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0176  16S rRNA-processing protein RimM  26.37 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1096  16S rRNA processing protein RimM  26.67 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0393461  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1474  16S rRNA-processing protein RimM  22.49 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2183  16S rRNA processing protein RimM  25.15 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0540  16S rRNA processing protein RimM  24.1 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000769846  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0096  16S rRNA-processing protein RimM  27.33 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000752452  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0648  16S rRNA processing protein RimM  27.17 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1662  16S rRNA-processing protein RimM  26.97 
 
 		 229 aa  45.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0748  16S rRNA-processing protein RimM  26.92 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2897  16S rRNA processing protein RimM  24.86 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0943  16S rRNA-processing protein RimM  24.24 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>