79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0453 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0453  16S rRNA processing protein RimM  100 
 
 		 179 aa  365  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1431  16S rRNA processing protein RimM  46.51 
 
 		 176 aa  154  9e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0566865  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1647  16S rRNA processing protein RimM  42.22 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1036  16S rRNA processing protein RimM  40.12 
 
 		 176 aa  130  9e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145928  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0678  16S rRNA processing protein RimM  43.5 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1294  16S rRNA processing protein RimM  40.8 
 
 		 179 aa  123  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0559  16S rRNA processing protein RimM  40.46 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.970702  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0812  16S rRNA processing protein RimM  40.8 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.335804  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0735  16S rRNA processing protein RimM  40.23 
 
 		 179 aa  120  8e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.335769  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0994  16S rRNA processing protein  41.88 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1302  16S rRNA-processing protein RimM  26.74 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000535622  unclonable  1.06066e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3941  16S rRNA-processing protein RimM  26.74 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000195727  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1803  16S rRNA processing protein RimM  31.74 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000356142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3665  16S rRNA-processing protein RimM  25 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000001599  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1091  16S rRNA-processing protein RimM  27.22 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000655231  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0365  16S rRNA processing protein RimM  27.78 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000438185  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0712  16S rRNA-processing protein RimM  30.38 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000237491  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0805  16S rRNA-processing protein RimM  26.16 
 
 		 167 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000311839  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0659  16S rRNA processing protein RimM  27.91 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0110024  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1016  16S rRNA processing protein RimM  26.16 
 
 		 169 aa  51.2  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000810353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2494  16S rRNA-processing protein RimM  23.84 
 
 		 171 aa  51.2  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000966692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3890  16S rRNA-processing protein RimM  23.26 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000177338  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2874  16S rRNA processing protein RimM  26.6 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3980  16S rRNA-processing protein RimM  23.26 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000074804  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3583  16S rRNA-processing protein RimM  23.26 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.00886e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3693  16S rRNA-processing protein RimM  23.26 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000284682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3884  16S rRNA-processing protein RimM  23.26 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000398495  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1160  16S rRNA-processing protein RimM  30.68 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000339506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1632  16S rRNA processing protein RimM  31.82 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4068  16S rRNA-processing protein RimM  29.27 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.199941  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3366  16S rRNA processing protein RimM  29.38 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.83337 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3601  16S rRNA-processing protein RimM  23.26 
 
 		 171 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000401419  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2452  16S rRNA processing protein RimM  23.3 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000919836  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1984  16S rRNA-processing protein RimM  23.89 
 
 		 172 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1682  16S rRNA-processing protein RimM  26.22 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00118486  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1169  16S rRNA-processing protein RimM  28.74 
 
 		 176 aa  48.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000549178  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0096  16S rRNA-processing protein RimM  28.57 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000752452  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0883  16S rRNA processing protein RimM  31.53 
 
 		 179 aa  47.8  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000602503  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1301  16S rRNA processing protein RimM  28.22 
 
 		 162 aa  47.8  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0244939  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1064  16S rRNA-processing protein RimM  28.14 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000154206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4207  16S rRNA-processing protein RimM  25.6 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.408553  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1964  16S rRNA-processing protein RimM  26.22 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1255  16S rRNA-processing protein RimM  28.41 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000136012  hitchhiker  0.0000512506 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10000  16S rRNA processing protein RimM  22.56 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0953699  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4117  16S rRNA-processing protein RimM  26.06 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0890  16S rRNA-processing protein RimM  26.95 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000503781  normal  0.334216 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1050  16S rRNA-processing protein RimM  27.84 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1211  16S rRNA-processing protein RimM  28.74 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000458928  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1288  16S rRNA-processing protein RimM  28.74 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000110365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1255  16S rRNA-processing protein RimM  28.74 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000416795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3102  16S rRNA-processing protein RimM  28.74 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000126118  normal  0.166795 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0787  16S rRNA-processing protein RimM  27.22 
 
 		 173 aa  45.1  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.0056e-16  unclonable  2.29437e-28 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1691  16S rRNA-processing protein RimM  25.81 
 
 		 213 aa  44.7  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1298  16S rRNA-processing protein RimM  24.42 
 
 		 167 aa  44.3  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1152  16S rRNA-processing protein RimM  22.75 
 
 		 168 aa  44.3  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355761  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1323  16S rRNA-processing protein RimM  24.42 
 
 		 167 aa  44.3  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000721778  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09170  16S rRNA processing protein RimM  23.66 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1462  16S rRNA-processing protein RimM  25.93 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0847  16S rRNA processing protein RimM  28.57 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2144  16S rRNA processing protein RimM  23.2 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4078  16S rRNA-processing protein RimM  25.53 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3753  16S rRNA-processing protein RimM  24.86 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2919  16S rRNA-processing protein RimM  26.95 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000363709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2837  16S rRNA-processing protein RimM  26.95 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0294  16S rRNA-processing protein RimM  25.6 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000244736  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0650  16S rRNA-processing protein RimM  27.84 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.182958  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1578  16S rRNA-processing protein RimM  26.4 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.637772  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3016  16S rRNA-processing protein RimM  26.35 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000828768  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1358  16S rRNA-processing protein RimM  25.42 
 
 		 177 aa  42.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4627  16S rRNA-processing protein RimM  28.69 
 
 		 208 aa  42.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4076  16S rRNA-processing protein RimM  24.86 
 
 		 189 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0551  16S rRNA-processing protein RimM  35.34 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  2.44188e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3615  16S rRNA-processing protein RimM  21.91 
 
 		 231 aa  42  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.900619  hitchhiker  0.00782345 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0967  16S rRNA processing protein RimM  25.77 
 
 		 167 aa  41.6  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000740944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03479  16S rRNA-processing protein RimM  27.39 
 
 		 182 aa  41.6  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17981  16S rRNA-processing protein RimM  26.46 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.581865  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2581  16S rRNA processing protein RimM  24.14 
 
 		 186 aa  41.2  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00383976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0800  16S rRNA processing protein RimM  23.49 
 
 		 166 aa  40.8  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0383963  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1091  16S rRNA-processing protein RimM  25.64 
 
 		 233 aa  40.8  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166922  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>