85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0559 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0559  16S rRNA processing protein RimM  100 
 
 		 176 aa  347  6e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.970702  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1294  16S rRNA processing protein RimM  53.63 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0735  16S rRNA processing protein RimM  53.07 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.335769  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0812  16S rRNA processing protein RimM  53.07 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.335804  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1036  16S rRNA processing protein RimM  49.43 
 
 		 176 aa  170  1e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145928  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1431  16S rRNA processing protein RimM  45.45 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0566865  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0678  16S rRNA processing protein RimM  44.89 
 
 		 176 aa  155  4e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0994  16S rRNA processing protein  50.62 
 
 		 158 aa  147  7e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1647  16S rRNA processing protein RimM  39.2 
 
 		 179 aa  123  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0453  16S rRNA processing protein RimM  40.46 
 
 		 179 aa  122  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1535  16S rRNA processing protein RimM  30.99 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00265207  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1091  16S rRNA-processing protein RimM  24.86 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0712  16S rRNA-processing protein RimM  29.76 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000237491  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0365  16S rRNA processing protein RimM  26.63 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000438185  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1301  16S rRNA processing protein RimM  31.48 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0244939  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2494  16S rRNA-processing protein RimM  25.16 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000966692  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1386  16S rRNA-processing protein RimM  27.08 
 
 		 207 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3665  16S rRNA-processing protein RimM  27.1 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000001599  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2406  16S rRNA-processing protein RimM  30.95 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000189149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2052  16S rRNA processing protein RimM  26.04 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000163547  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3941  16S rRNA-processing protein RimM  25.81 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000195727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1302  16S rRNA-processing protein RimM  26.45 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000535622  unclonable  1.06066e-25 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0800  16S rRNA processing protein RimM  27.78 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0383963  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0805  16S rRNA-processing protein RimM  27.27 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000311839  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1323  16S rRNA-processing protein RimM  27.11 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000721778  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1298  16S rRNA-processing protein RimM  27.11 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2674  16S rRNA processing protein RimM  25.29 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109453  hitchhiker  0.000000299021 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3890  16S rRNA-processing protein RimM  27.74 
 
 		 171 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000177338  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1415  16S rRNA processing protein RimM  27.11 
 
 		 181 aa  52  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000206982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3884  16S rRNA-processing protein RimM  27.74 
 
 		 171 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000398495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3980  16S rRNA-processing protein RimM  27.74 
 
 		 171 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000074804  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3583  16S rRNA-processing protein RimM  27.74 
 
 		 171 aa  52.4  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.00886e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3693  16S rRNA-processing protein RimM  27.74 
 
 		 171 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000284682  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1659  16S rRNA-processing protein RimM  25 
 
 		 171 aa  51.2  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0970  16S rRNA-processing protein RimM  31.48 
 
 		 169 aa  51.2  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000015249  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4207  16S rRNA-processing protein RimM  25 
 
 		 221 aa  50.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.408553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2452  16S rRNA processing protein RimM  25.73 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000919836  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0659  16S rRNA processing protein RimM  24.7 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0110024  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4627  16S rRNA-processing protein RimM  30.87 
 
 		 208 aa  50.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0767  16S rRNA-processing protein RimM  27.11 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000495507  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1355  16S rRNA processing protein RimM  24.7 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000116768  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3443  16S rRNA-processing protein RimM  23.26 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1984  16S rRNA-processing protein RimM  25.31 
 
 		 172 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3601  16S rRNA-processing protein RimM  27.1 
 
 		 171 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000401419  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1803  16S rRNA processing protein RimM  24.29 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000356142  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1632  16S rRNA processing protein RimM  31.01 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1091  16S rRNA-processing protein RimM  25.31 
 
 		 172 aa  48.5  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000655231  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20561  16S rRNA-processing protein RimM  24.55 
 
 		 176 aa  48.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.656397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3882  16S rRNA-processing protein RimM  22.7 
 
 		 167 aa  47.8  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.13781  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1181  16S rRNA-processing protein RimM  24.55 
 
 		 176 aa  47.8  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.612534  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1105  16S rRNA-processing protein RimM  21.99 
 
 		 193 aa  47.8  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1355  16S rRNA-processing protein RimM  27.85 
 
 		 172 aa  47.8  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000868178  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0787  16S rRNA-processing protein RimM  24.85 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.0056e-16  unclonable  2.29437e-28 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0176  16S rRNA-processing protein RimM  20.75 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1384  16S rRNA-processing protein RimM  27.16 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00157124  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4117  16S rRNA-processing protein RimM  27.01 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4068  16S rRNA-processing protein RimM  27.98 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.199941  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4970  16S rRNA processing protein RimM  24.48 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0648  16S rRNA processing protein RimM  31.36 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3065  16S rRNA processing protein RimM  21.47 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000508882  hitchhiker  0.000000546045 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07320  16S rRNA processing protein RimM  26.9 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000238844  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0748  16S rRNA-processing protein RimM  21.64 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0324  16S rRNA processing protein RimM  21.51 
 
 		 199 aa  45.8  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.884603 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2781  16S rRNA-processing protein RimM  25.88 
 
 		 173 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00810863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2581  16S rRNA processing protein RimM  27.34 
 
 		 186 aa  45.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00383976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2609  16S rRNA-processing protein RimM  22.22 
 
 		 171 aa  45.1  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.740533  normal  0.0121185 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0130  16S rRNA-processing protein RimM  22.94 
 
 		 177 aa  45.1  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0512614  normal  0.0110832 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0164  16S rRNA processing protein RimM  22.22 
 
 		 217 aa  44.7  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.199907  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1224  16S rRNA processing protein RimM  29.41 
 
 		 176 aa  44.7  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135812  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0890  16S rRNA-processing protein RimM  29.09 
 
 		 176 aa  44.3  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000503781  normal  0.334216 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1231  16S rRNA processing protein RimM  29.41 
 
 		 176 aa  44.7  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000213348  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1293  16S rRNA processing protein RimM  24.39 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000894981  normal  0.803159 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4078  16S rRNA-processing protein RimM  26.28 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3429  16S rRNA processing protein RimM  25.69 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000572848  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2051  16S rRNA processing protein RimM  29.46 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17291  16S rRNA-processing protein RimM  23.73 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3098  16S rRNA-processing protein RimM  26.06 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  0.9458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2702  16S rRNA-processing protein RimM  22.54 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.294971  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0344  16S rRNA-processing protein RimM  21.56 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0682  16S rRNA-processing protein RimM  16.84 
 
 		 194 aa  42  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0085  16S rRNA-processing protein RimM  26.05 
 
 		 191 aa  42  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3753  16S rRNA-processing protein RimM  23.12 
 
 		 189 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0182  16S rRNA-processing protein RimM  22.22 
 
 		 169 aa  42  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1499  16S rRNA processing protein RimM  25 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.105109  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1160  16S rRNA-processing protein RimM  28.4 
 
 		 176 aa  41.2  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000339506  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>