102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5245 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5245  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 420 aa  858    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0563455 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7087  ABC transporter substrate-binding protein  52.52 
 
 		 435 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6133  putative substrate-binding component of ABC transporter  46.45 
 
 		 417 aa  347  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5539  ABC transporter substrate-binding protein  43.37 
 
 		 426 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0803518  hitchhiker  0.00000350864 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7438  ABC transporter substrate-binding protein  42.34 
 
 		 464 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4801  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  37.65 
 
 		 439 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.409444  normal  0.455184 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4890  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  36.9 
 
 		 434 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.669186 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0640  twin-arginine translocation pathway signal  35.7 
 
 		 473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.35602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5994  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  35.04 
 
 		 506 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0598696  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0643  Extracellular ligand-binding receptor  25.34 
 
 		 395 aa  76.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0141  extracellular ligand-binding receptor  23.61 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.202322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  25.38 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.58 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  22.31 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3645  extracellular ligand-binding receptor  22.68 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.218866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2268  extracellular ligand-binding receptor  20 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0458822  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4487  extracellular ligand-binding receptor  23.5 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00567759  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2140  extracellular ligand-binding receptor  22.37 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0562  extracellular ligand-binding receptor  32.58 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.419655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  22.54 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0549  extracellular ligand-binding receptor  23.5 
 
 		 453 aa  57  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.183642  hitchhiker  0.0000167924 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0446  extracellular ligand-binding receptor  24.02 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  20.93 
 
 		 383 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  32.5 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  21.74 
 
 		 383 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4869  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  31.43 
 
 		 236 aa  54.7  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.350641 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  30.08 
 
 		 387 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1524  extracellular ligand-binding receptor  23.22 
 
 		 459 aa  53.1  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0533175  normal  0.466259 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  22.69 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3105  extracellular ligand-binding receptor  24.5 
 
 		 389 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0848  extracellular ligand-binding receptor  24.02 
 
 		 470 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.762199 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  20.35 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  30.09 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2499  twin-arginine translocation pathway signal  21.35 
 
 		 407 aa  51.6  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0117  extracellular ligand-binding receptor  24.46 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  23.75 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5642  extracellular ligand-binding receptor  23.08 
 
 		 411 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1972  extracellular ligand-binding receptor  23.93 
 
 		 403 aa  50.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3303  amide-urea binding protein  23.16 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4492  extracellular ligand-binding receptor  23.67 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.531817 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  20.17 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  25.4 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  23.77 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3194  Extracellular ligand-binding receptor  23.58 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1548  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.18 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1847  twin-arginine translocation pathway signal  21.49 
 
 		 416 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.553437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2884  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  19.93 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  23.14 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1559  Extracellular ligand-binding receptor  24.19 
 
 		 386 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  24.84 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  22.79 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 		 391 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0480  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  22.86 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.199357  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3428  extracellular ligand-binding receptor  25.78 
 
 		 388 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0552  extracellular ligand-binding receptor  24.7 
 
 		 377 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0988947  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22980  amino acid-binding protein  28.23 
 
 		 434 aa  47.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0512293  normal  0.104714 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3506  extracellular ligand-binding receptor  23.53 
 
 		 388 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3989  extracellular ligand-binding receptor  23.53 
 
 		 388 aa  47  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.143637 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2101  Extracellular ligand-binding receptor  23.84 
 
 		 380 aa  47  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  22.99 
 
 		 380 aa  46.6  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1950  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.44 
 
 		 388 aa  46.6  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  26.17 
 
 		 378 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  26.17 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7597  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.89 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1136  twin-arginine translocation pathway signal  26.18 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.206863 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  20.56 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  23.71 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  26.17 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  26.17 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5696  extracellular ligand-binding receptor  24.55 
 
 		 382 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.668558  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1539  Extracellular ligand-binding receptor  20.8 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  27.59 
 
 		 390 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3748  Extracellular ligand-binding receptor  24.4 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  23.51 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  24.18 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0355  extracellular ligand-binding receptor  25.39 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4424  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.17 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000310805  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  22.35 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3427  ABC transporter substrate-binding protein  30.39 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  22.87 
 
 		 389 aa  45.8  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1761  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.87 
 
 		 467 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  22.35 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  23.16 
 
 		 417 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  23.9 
 
 		 390 aa  45.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2030  LivK, ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  23.57 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.438312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4271  extracellular ligand-binding receptor  24.89 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4095  extracellular ligand-binding receptor  24.89 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4443  extracellular ligand-binding receptor  25.37 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4013  extracellular ligand-binding receptor  30.23 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00118971  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  25.74 
 
 		 383 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  24.47 
 
 		 370 aa  44.3  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  23.27 
 
 		 389 aa  44.3  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  22.68 
 
 		 387 aa  43.9  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  24.53 
 
 		 390 aa  43.9  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  25.51 
 
 		 404 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3733  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  23.08 
 
 		 415 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6455  hypothetical protein  22.28 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000370315  hitchhiker  0.00000000486051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3114  Extracellular ligand-binding receptor  27.18 
 
 		 364 aa  43.5  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  24.11 
 
 		 370 aa  43.1  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 		 398 aa  43.5  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>