168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3231 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3231  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  645    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2276  hypothetical protein  74.1 
 
 		 306 aa  474  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.998635 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3057  hypothetical protein  74.75 
 
 		 306 aa  471  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.023452 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2793  hypothetical protein  74.43 
 
 		 306 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.588603  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  60.68 
 
 		 301 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  62.03 
 
 		 308 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1557  hypothetical protein  61.81 
 
 		 310 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1608  hypothetical protein  62.41 
 
 		 309 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278109  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1008  hypothetical protein  48.79 
 
 		 303 aa  293  3e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.842733  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2947  hypothetical protein  46.48 
 
 		 324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.207971  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  45.29 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  45.29 
 
 		 313 aa  246  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1375  hypothetical protein  42.3 
 
 		 310 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  43.57 
 
 		 318 aa  245  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  43.66 
 
 		 312 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  43.62 
 
 		 312 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0915  hypothetical protein  43.57 
 
 		 312 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  44.52 
 
 		 304 aa  235  7e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0785  protein of unknown function DUF58  46.81 
 
 		 318 aa  232  5e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  44.18 
 
 		 304 aa  230  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1455  protein of unknown function DUF58  44.52 
 
 		 304 aa  230  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.296497 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3636  hypothetical protein  47.39 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5170  protein of unknown function DUF58  45.9 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4481  hypothetical protein  46.27 
 
 		 303 aa  215  8e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2233  hypothetical protein  41.7 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2843  hypothetical protein  44.6 
 
 		 312 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0724  hypothetical protein  40.62 
 
 		 299 aa  188  9e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  37.23 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0370  hypothetical protein  41.78 
 
 		 312 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361803  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2768  hypothetical protein  35.92 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  35.23 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3012  protein of unknown function DUF58  39.33 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0180166  normal  0.251774 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1023  hypothetical protein  37.85 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0204  hypothetical protein  39.58 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2684  hypothetical protein  37.85 
 
 		 290 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506862  normal  0.625931 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3902  hypothetical protein  34.46 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2006  hypothetical protein  39.45 
 
 		 287 aa  122  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  30.74 
 
 		 293 aa  89.7  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  26.79 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  27.31 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  24.05 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  27.86 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  30.49 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  25.32 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  26.38 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  27.02 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  29.48 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  27.24 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  27.18 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  24.18 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  29.39 
 
 		 295 aa  67  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  22.22 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  25.72 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  30.5 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  24.2 
 
 		 287 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  23.16 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  30.14 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  26.59 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  24.45 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  25.31 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  25.95 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  26.3 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  26.56 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  23.02 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  23.13 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  26.77 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  25.23 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1953  protein of unknown function DUF58  30.34 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534202  hitchhiker  0.00411343 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  24.03 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  26.45 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  24.49 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  24.41 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  26.25 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  23 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  27.47 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  28.85 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  25.17 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  26.91 
 
 		 340 aa  57  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  29.1 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  27.41 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  28.19 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  26.15 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  25.4 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  22.18 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  24.37 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  23.81 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  29.17 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  27.47 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  31.65 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  22.22 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  25.56 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  24.37 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  27.16 
 
 		 302 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  23.08 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  28.1 
 
 		 323 aa  53.9  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  29.15 
 
 		 350 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  24.77 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  29.49 
 
 		 329 aa  53.1  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  27.16 
 
 		 302 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  24.71 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>