227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1677 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  631  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  57.28 
 
 		 338 aa  309  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1953  protein of unknown function DUF58  56.96 
 
 		 322 aa  305  9.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534202  hitchhiker  0.00411343 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  58.36 
 
 		 311 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  56.71 
 
 		 323 aa  278  6e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  48.47 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  48.47 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  48.47 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  51.52 
 
 		 366 aa  239  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  47.8 
 
 		 316 aa  239  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  50 
 
 		 338 aa  239  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  50.85 
 
 		 331 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  48.15 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  48.01 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  48.5 
 
 		 317 aa  236  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  52.03 
 
 		 350 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  48.47 
 
 		 302 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  45.15 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  46.42 
 
 		 312 aa  233  5e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  51.01 
 
 		 334 aa  233  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  49.38 
 
 		 339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  48.99 
 
 		 350 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  49.38 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  49.53 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  37.04 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  36.58 
 
 		 329 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  39.09 
 
 		 353 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  34.74 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  36.71 
 
 		 309 aa  139  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  37.5 
 
 		 328 aa  136  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  37.29 
 
 		 363 aa  135  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  38.28 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  33.1 
 
 		 295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  26.99 
 
 		 287 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  32.69 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  32.69 
 
 		 294 aa  116  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  26.86 
 
 		 287 aa  116  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  31.38 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  26.74 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  28.78 
 
 		 288 aa  112  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  22.65 
 
 		 290 aa  106  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  28.32 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  26.35 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  25.37 
 
 		 291 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  27.78 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  33.33 
 
 		 418 aa  95.9  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  27.69 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  25.94 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  26.28 
 
 		 297 aa  95.1  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  23.91 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  26.54 
 
 		 328 aa  93.2  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  26.52 
 
 		 295 aa  92.4  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.82 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  26.55 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  25.67 
 
 		 286 aa  88.2  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  27.14 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  28.73 
 
 		 287 aa  87.4  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  25.71 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.97 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  27.94 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  26.48 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  30.47 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  27.05 
 
 		 296 aa  82.4  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  22.42 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  30.47 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  29.28 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  22.46 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  25.89 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  29.85 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  28.62 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  24.91 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  30.77 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  28.16 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  22.33 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  25.85 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  26.9 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  28.28 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  24.44 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  25.42 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  30 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  27.48 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  26.58 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  29.58 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  26.15 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  28.91 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  22.61 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2276  hypothetical protein  26.99 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.998635 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3057  hypothetical protein  26.39 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.023452 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  24.05 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  24.81 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2793  hypothetical protein  26.55 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.588603  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  27.01 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  26.54 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  24.59 
 
 		 292 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  25.93 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  25.62 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  28.02 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  27.27 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  27.54 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  30.8 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>