294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3246 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  648    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  86.54 
 
 		 363 aa  498  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  71.24 
 
 		 329 aa  428  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  68.87 
 
 		 309 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  61.28 
 
 		 353 aa  326  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  47.5 
 
 		 418 aa  262  4.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  41.06 
 
 		 340 aa  223  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  37.46 
 
 		 291 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  41.25 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  40.4 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  42.47 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  40.51 
 
 		 331 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  34.3 
 
 		 287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  41.77 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  41.38 
 
 		 317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  39.75 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  39.52 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  39.52 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  39.52 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  36.49 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  34.74 
 
 		 291 aa  189  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  36.5 
 
 		 290 aa  189  5.999999999999999e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  44.03 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  37.85 
 
 		 292 aa  185  9e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  30.94 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  40.31 
 
 		 339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  30.22 
 
 		 287 aa  182  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  33.06 
 
 		 287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  38.14 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  41.14 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  39.51 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  37.1 
 
 		 312 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  43 
 
 		 311 aa  176  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  38.75 
 
 		 317 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  36.16 
 
 		 309 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  41.2 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  31.82 
 
 		 290 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  37.89 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  37.2 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  37.81 
 
 		 302 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  37.5 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  35.38 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  35.52 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  35.06 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  37.04 
 
 		 294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  39.24 
 
 		 328 aa  165  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  36.49 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  32.63 
 
 		 296 aa  161  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  31.6 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  39.41 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  30.74 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  31.45 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  31.63 
 
 		 296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  37.5 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  34.71 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  28.98 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1953  protein of unknown function DUF58  38.97 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534202  hitchhiker  0.00411343 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  28 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  32.56 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  28.12 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  27.24 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  32.77 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  31.27 
 
 		 303 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  32.55 
 
 		 287 aa  126  6e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  28.52 
 
 		 345 aa  122  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  30.58 
 
 		 303 aa  122  8e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  27.02 
 
 		 293 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  31.25 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  29.05 
 
 		 329 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  29.41 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  30.55 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  30.55 
 
 		 318 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  30.55 
 
 		 318 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  30.36 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  31.8 
 
 		 312 aa  106  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  27.82 
 
 		 304 aa  106  7e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  33.21 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  29.82 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  29.96 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  33.21 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  35.91 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  33.21 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  29.82 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  35.98 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  30.32 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  28.02 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  29.2 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  29.96 
 
 		 294 aa  99  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  34 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  25.68 
 
 		 276 aa  97.4  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  25.75 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  24.44 
 
 		 308 aa  97.1  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  27 
 
 		 330 aa  97.1  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  30.94 
 
 		 314 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  33.59 
 
 		 309 aa  96.7  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  25.86 
 
 		 331 aa  95.9  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  25.86 
 
 		 331 aa  95.9  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  28.63 
 
 		 323 aa  95.9  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  31.13 
 
 		 393 aa  95.5  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  28.52 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>