More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0112 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
309 aa  635    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  67.77 
 
 
302 aa  424  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  63.76 
 
 
296 aa  393  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  65.56 
 
 
297 aa  381  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  59.73 
 
 
296 aa  365  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  59.31 
 
 
292 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  43.31 
 
 
287 aa  262  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  42.76 
 
 
288 aa  261  1e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  41.34 
 
 
287 aa  256  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  45.3 
 
 
292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  40.28 
 
 
287 aa  245  8e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  41.67 
 
 
291 aa  239  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  39.86 
 
 
291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  41.16 
 
 
295 aa  232  6e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  40.21 
 
 
290 aa  232  8.000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  39.58 
 
 
290 aa  226  3e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  43.25 
 
 
286 aa  220  3e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  37.66 
 
 
328 aa  216  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  41.11 
 
 
295 aa  216  4e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  36.92 
 
 
295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  37.66 
 
 
296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  35.62 
 
 
296 aa  192  7e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  37.19 
 
 
295 aa  190  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  34.62 
 
 
295 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  34.15 
 
 
287 aa  183  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  41.13 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  40.69 
 
 
294 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  36.03 
 
 
328 aa  170  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  32.42 
 
 
329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  29.74 
 
 
340 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  32.04 
 
 
314 aa  155  7e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  33.78 
 
 
309 aa  155  9e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  33.68 
 
 
363 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  33 
 
 
317 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  31.61 
 
 
340 aa  150  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  30.69 
 
 
314 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  35.09 
 
 
318 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  35.09 
 
 
314 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  35.09 
 
 
318 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  32.77 
 
 
353 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  30.3 
 
 
328 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  30.58 
 
 
291 aa  138  1e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  30.34 
 
 
330 aa  136  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  30.34 
 
 
331 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  32.65 
 
 
314 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  30 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  36.7 
 
 
314 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  29.26 
 
 
345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  29.39 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  30.63 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  30.9 
 
 
338 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  29.03 
 
 
303 aa  126  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  35.21 
 
 
393 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  31.74 
 
 
299 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  34.36 
 
 
312 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  28.78 
 
 
302 aa  122  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  34.6 
 
 
304 aa  122  8e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  34.96 
 
 
312 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  31.44 
 
 
312 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  31.5 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  30.03 
 
 
328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  26.77 
 
 
329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  33.48 
 
 
312 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  26.48 
 
 
310 aa  119  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  34.6 
 
 
312 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  36.9 
 
 
329 aa  119  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  28.57 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  34.39 
 
 
335 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  38.29 
 
 
309 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  29.73 
 
 
276 aa  113  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  37.76 
 
 
310 aa  113  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  26.79 
 
 
293 aa  113  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  27.35 
 
 
320 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  32.58 
 
 
331 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  32.18 
 
 
351 aa  112  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  41.14 
 
 
317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  33.47 
 
 
309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  30.38 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  29.83 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  26.01 
 
 
312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  36.68 
 
 
317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  30.92 
 
 
318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  36.22 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  41.14 
 
 
317 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  36.68 
 
 
317 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  26.92 
 
 
350 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  36.93 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  34 
 
 
324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  42.54 
 
 
311 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  30 
 
 
296 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  30.49 
 
 
302 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  29.02 
 
 
317 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  32.63 
 
 
341 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  26.91 
 
 
323 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  27.27 
 
 
338 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  31.25 
 
 
302 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  28.77 
 
 
294 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  30.26 
 
 
306 aa  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  28.62 
 
 
315 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  28.62 
 
 
315 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>