More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1802 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
303 aa  626  1e-178  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  40.6 
 
 
310 aa  232  6e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  39.32 
 
 
299 aa  224  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  40.2 
 
 
309 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  37.85 
 
 
302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  36.64 
 
 
300 aa  212  7.999999999999999e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  38.23 
 
 
303 aa  206  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  40 
 
 
302 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  39.45 
 
 
302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  39.45 
 
 
302 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  37.28 
 
 
304 aa  199  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  38.91 
 
 
322 aa  194  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  39.47 
 
 
306 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  36.23 
 
 
295 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  33.56 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  37.63 
 
 
308 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  33.45 
 
 
309 aa  160  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  33.85 
 
 
296 aa  136  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  26.78 
 
 
300 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  31.62 
 
 
291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  28.67 
 
 
290 aa  125  7e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  30 
 
 
298 aa  125  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  33.06 
 
 
292 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  31.21 
 
 
302 aa  123  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  29.75 
 
 
309 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2702  hypothetical protein  30.14 
 
 
307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  31.62 
 
 
296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  30.04 
 
 
290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1974  hypothetical protein  31.06 
 
 
307 aa  119  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  30.9 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  32.02 
 
 
295 aa  116  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  27.82 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.56 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  29.71 
 
 
295 aa  113  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  29.41 
 
 
293 aa  112  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  26.67 
 
 
294 aa  113  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  29.02 
 
 
295 aa  112  6e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  26.83 
 
 
287 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  27.74 
 
 
288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  31.45 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  30.52 
 
 
287 aa  110  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  29.55 
 
 
328 aa  109  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  28.67 
 
 
295 aa  109  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  30.62 
 
 
340 aa  109  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  28.47 
 
 
296 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  27.31 
 
 
306 aa  108  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  27.18 
 
 
340 aa  108  9.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  27.87 
 
 
301 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  26.88 
 
 
308 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  28.11 
 
 
302 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  27.27 
 
 
293 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  29.6 
 
 
291 aa  106  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  35.23 
 
 
286 aa  105  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  26.78 
 
 
287 aa  104  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  27.24 
 
 
288 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  26.77 
 
 
296 aa  100  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  27.14 
 
 
291 aa  97.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  28.42 
 
 
306 aa  95.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  28.39 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  25.91 
 
 
284 aa  94.7  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  30.81 
 
 
308 aa  94  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  31.75 
 
 
294 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  29.03 
 
 
331 aa  94  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  30.11 
 
 
310 aa  93.2  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  30.05 
 
 
287 aa  92.8  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  30.89 
 
 
312 aa  92  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  30.48 
 
 
314 aa  91.3  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  28.14 
 
 
325 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  28.63 
 
 
329 aa  89.7  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  29.8 
 
 
303 aa  89.4  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  27.71 
 
 
353 aa  89  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  29.03 
 
 
358 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  26.28 
 
 
350 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  29.71 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 
350 aa  87.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  29.6 
 
 
325 aa  86.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  27.6 
 
 
315 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  24.1 
 
 
283 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  27.6 
 
 
315 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  27.6 
 
 
315 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  29.9 
 
 
321 aa  86.7  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  28.28 
 
 
303 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  27.15 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  30.86 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  28.18 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  26.24 
 
 
316 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  28.81 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  24.65 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0043  hypothetical protein  31.41 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  26.7 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  30.33 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  29.73 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  32.99 
 
 
311 aa  82  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  27.65 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  27.35 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  29 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  28.34 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  26.89 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  27.8 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>