211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1974 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1974  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  622  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2702  hypothetical protein  87.3 
 
 		 307 aa  549  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  48.21 
 
 		 306 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  46.05 
 
 		 301 aa  238  6.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  40.69 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  40.34 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  36.84 
 
 		 291 aa  182  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  36.7 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  36.4 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  36.52 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  32.86 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  36.11 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  31.06 
 
 		 303 aa  119  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  25.69 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  28.62 
 
 		 299 aa  99.8  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  28.62 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  32.32 
 
 		 296 aa  99.8  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0823  protein of unknown function DUF58  28.47 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0043  hypothetical protein  28.1 
 
 		 288 aa  97.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  25.43 
 
 		 290 aa  95.9  7e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  31.77 
 
 		 288 aa  95.5  9e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  26.97 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  25.45 
 
 		 293 aa  93.2  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  28.51 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  34.38 
 
 		 292 aa  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  32.12 
 
 		 306 aa  90.9  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  25.7 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  30.51 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  25.94 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  22.89 
 
 		 288 aa  87.4  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  29.55 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  28.76 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  27.17 
 
 		 284 aa  86.3  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  26.55 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  26.16 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  28.46 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  28.29 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  22.57 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  28.43 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  29.76 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  22.46 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  29.91 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  27.62 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  23.83 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  31.07 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  27.39 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  24.22 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  30.22 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  24.63 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  23.41 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  27.18 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  27.75 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  25.59 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  25 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  26.87 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  26.53 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  28.64 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  32.05 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  26.53 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  31.77 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  31.28 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  28.1 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  28.1 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  28.1 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  29.76 
 
 		 323 aa  67  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  23.88 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  29.29 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  24.9 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  26.86 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  29.46 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  24.44 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  27.49 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  27.54 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  27.08 
 
 		 302 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  30.12 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  24.61 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  32.12 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  26.07 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  28.52 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  34.21 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  30.25 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  29.63 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  28.42 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  24.07 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  27.55 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  23.58 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  34.71 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  34.59 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  25.75 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  25.36 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  38.54 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  34.59 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  27.56 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  34.58 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  33.83 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  27.44 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  33.63 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  29.76 
 
 		 575 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  33.64 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>