More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1364 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  581  1.0000000000000001e-165  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  35.46 
 
 
293 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  35.36 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  35.79 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  29.64 
 
 
292 aa  145  8.000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  31.33 
 
 
308 aa  143  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  31.25 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  33.46 
 
 
299 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  31.14 
 
 
296 aa  122  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  31.08 
 
 
302 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  30.4 
 
 
309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  33.48 
 
 
302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  30.29 
 
 
291 aa  119  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  30.35 
 
 
298 aa  113  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  30.11 
 
 
303 aa  112  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  27.74 
 
 
303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  27.7 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  32.11 
 
 
304 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  26.84 
 
 
309 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  28.74 
 
 
301 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2702  hypothetical protein  31.3 
 
 
307 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  30.11 
 
 
303 aa  102  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  33.68 
 
 
310 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  27.17 
 
 
295 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  30.33 
 
 
340 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  31.25 
 
 
295 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  31.88 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  30.04 
 
 
287 aa  96.3  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  27.76 
 
 
290 aa  95.9  7e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1974  hypothetical protein  31.77 
 
 
307 aa  95.5  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  26.94 
 
 
287 aa  95.5  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  28.18 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  27.75 
 
 
298 aa  93.2  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  31.09 
 
 
322 aa  92.8  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  27.96 
 
 
312 aa  92.4  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  27.83 
 
 
288 aa  92.4  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  28.91 
 
 
302 aa  92.4  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  26.13 
 
 
291 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  28.51 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  28.91 
 
 
302 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  30.77 
 
 
340 aa  90.1  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  28.44 
 
 
302 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.55 
 
 
296 aa  90.1  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  26.77 
 
 
309 aa  89.7  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  26.92 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  26.57 
 
 
290 aa  88.2  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  28.63 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  24.59 
 
 
295 aa  87.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  24.54 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  28.5 
 
 
309 aa  87  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  29.13 
 
 
353 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  39.13 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  27.86 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  28.09 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  25.19 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  26.25 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  28.69 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  29.46 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  33.05 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  32.06 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  28.65 
 
 
363 aa  82.8  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0915  hypothetical protein  26.88 
 
 
312 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  28.14 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0823  protein of unknown function DUF58  27.87 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  31.05 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  26.32 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  26.83 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0043  hypothetical protein  29.12 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  31.97 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  28.57 
 
 
317 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  28.89 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  26.81 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  28.51 
 
 
338 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  27.69 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  27.69 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  29.55 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  29.24 
 
 
309 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  24.03 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  30.3 
 
 
350 aa  77  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  25.98 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  25.98 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  25.98 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  27.69 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  29.41 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  36.8 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  25.09 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  28.52 
 
 
319 aa  75.5  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  25.96 
 
 
295 aa  75.5  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  30.62 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  29.82 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  28.15 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  27.94 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  29.81 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  27.75 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  28.63 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  26.84 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  26.07 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  28.24 
 
 
312 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  40.23 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  21.75 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>