274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1889 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  613  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  94.26 
 
 		 296 aa  572  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  67.35 
 
 		 291 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  58.7 
 
 		 294 aa  371  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  43 
 
 		 309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2702  hypothetical protein  40.69 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  35.69 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1974  hypothetical protein  40.69 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  40.21 
 
 		 303 aa  199  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  40.14 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  38.44 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  33.89 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0823  protein of unknown function DUF58  33.68 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  32.99 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  31.01 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  34.12 
 
 		 309 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  27.74 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  26.57 
 
 		 293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  33.48 
 
 		 288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0043  hypothetical protein  26.06 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  30.77 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  31.51 
 
 		 302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  29.29 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  31.51 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  31.41 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  30.14 
 
 		 300 aa  112  8.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  32.37 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  28.11 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  30.58 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  27.31 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  30.42 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.04 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  29.02 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  32.2 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  27.95 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  26.32 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  28.67 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  32.34 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  26.41 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  29.29 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  27.97 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  26.1 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  27.63 
 
 		 303 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  25.8 
 
 		 295 aa  99  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  31.75 
 
 		 295 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  26.43 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  29.23 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  34.51 
 
 		 292 aa  96.7  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  25.25 
 
 		 304 aa  95.5  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  25.26 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  29.18 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  29.14 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  32.5 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  29.32 
 
 		 283 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  25.4 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  31.76 
 
 		 331 aa  89.7  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  26.74 
 
 		 290 aa  89.4  6e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  28.09 
 
 		 310 aa  89.4  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  26.24 
 
 		 291 aa  89.4  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  27.51 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  24.91 
 
 		 288 aa  88.6  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  31.82 
 
 		 302 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  25.75 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  32.92 
 
 		 316 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  23.33 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  27.5 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  27.34 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  31.14 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  32.63 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  28.63 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  31.15 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  31.4 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  26.88 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  28.81 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  28.62 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  30.57 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  26.12 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  25.82 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  31.52 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  31.52 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  31.52 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  25.55 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  26.79 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  25 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  33.73 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  33.73 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  33.73 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  29.87 
 
 		 311 aa  75.5  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  29 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  30.13 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  31 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  30.2 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  29.29 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  30.74 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  33.13 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  30.74 
 
 		 339 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  30.04 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  31.23 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1638  protein of unknown function DUF58  30 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.717641 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  31.93 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>