More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1642 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  588  1e-167  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  47.22 
 
 
291 aa  298  7e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  39.93 
 
 
295 aa  248  6e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  40.41 
 
 
295 aa  243  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  42.6 
 
 
290 aa  236  4e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  39.78 
 
 
295 aa  231  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  41.34 
 
 
287 aa  229  3e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  44.63 
 
 
288 aa  226  3e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  43.92 
 
 
287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  39.27 
 
 
287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  38.24 
 
 
291 aa  218  8.999999999999998e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  41.51 
 
 
309 aa  218  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  43.85 
 
 
295 aa  218  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  36.93 
 
 
292 aa  217  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  36.93 
 
 
296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  36.08 
 
 
292 aa  212  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  36.46 
 
 
302 aa  205  7e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  39.62 
 
 
297 aa  202  6e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  34.97 
 
 
296 aa  199  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  40.98 
 
 
286 aa  196  3e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  33.55 
 
 
328 aa  196  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  32.51 
 
 
340 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  34.67 
 
 
287 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  31.99 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  31.63 
 
 
329 aa  172  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  30.38 
 
 
296 aa  172  5e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  34.71 
 
 
294 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  34.71 
 
 
294 aa  168  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  33.68 
 
 
363 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  37.08 
 
 
296 aa  165  8e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  31.82 
 
 
328 aa  159  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  30.91 
 
 
309 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  37.95 
 
 
287 aa  156  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  31.54 
 
 
340 aa  155  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  31.23 
 
 
353 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  31.46 
 
 
291 aa  152  5e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  27.61 
 
 
325 aa  152  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  27.93 
 
 
310 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  35.89 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  28.28 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  28.28 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  28.28 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  27.59 
 
 
350 aa  144  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  30.34 
 
 
299 aa  143  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  26.9 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  27.3 
 
 
312 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  28.52 
 
 
317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  25.76 
 
 
366 aa  135  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  27.48 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  27.18 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  26.48 
 
 
316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  26.76 
 
 
310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  31.86 
 
 
298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  28.67 
 
 
303 aa  125  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  26.67 
 
 
328 aa  125  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  31.93 
 
 
331 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  26.69 
 
 
418 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  28.28 
 
 
350 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  30.22 
 
 
334 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  26.74 
 
 
339 aa  122  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  28.62 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  30.23 
 
 
328 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  28.51 
 
 
325 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  27.3 
 
 
293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  30.22 
 
 
292 aa  119  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  31.43 
 
 
304 aa  118  9e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  25.34 
 
 
338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  27.43 
 
 
311 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  27.65 
 
 
322 aa  115  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  25 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  27.61 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  29.64 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  28.63 
 
 
323 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  34.74 
 
 
393 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  31.72 
 
 
331 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  29.62 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1953  protein of unknown function DUF58  27.67 
 
 
322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534202  hitchhiker  0.00411343 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  31.72 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  31.28 
 
 
330 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  27.53 
 
 
293 aa  109  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  25.55 
 
 
294 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  27.5 
 
 
302 aa  109  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  27.54 
 
 
309 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  29.23 
 
 
276 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  26 
 
 
318 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  27.3 
 
 
317 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  27.24 
 
 
287 aa  106  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  27.99 
 
 
306 aa  105  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  25.67 
 
 
318 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  24.57 
 
 
309 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  25.67 
 
 
314 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  29.26 
 
 
292 aa  103  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  24.58 
 
 
314 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  26.1 
 
 
291 aa  102  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  26.58 
 
 
304 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  27.66 
 
 
312 aa  102  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  26.83 
 
 
303 aa  102  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  26.76 
 
 
303 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  27.18 
 
 
314 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  28.02 
 
 
312 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>