More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1315 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  674    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  64.58 
 
 		 340 aa  409  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  43.46 
 
 		 329 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  43 
 
 		 363 aa  209  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  41.67 
 
 		 353 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  41.03 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  41.25 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  36.81 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  38.73 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  38.55 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  34.68 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  33.55 
 
 		 291 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  36.27 
 
 		 325 aa  175  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  31.27 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  32.67 
 
 		 287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  39.03 
 
 		 338 aa  172  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  31.35 
 
 		 288 aa  172  7.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  30.36 
 
 		 287 aa  169  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  37.77 
 
 		 294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  32.52 
 
 		 328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  39.35 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  37.22 
 
 		 294 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  38.67 
 
 		 350 aa  162  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  38.63 
 
 		 325 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  31.54 
 
 		 290 aa  155  7e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  32.44 
 
 		 287 aa  155  8e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  33.33 
 
 		 296 aa  155  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  34.72 
 
 		 339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  31.72 
 
 		 296 aa  153  5e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  30.1 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  34.75 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  35.55 
 
 		 366 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  33.76 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  33.12 
 
 		 312 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  35.02 
 
 		 350 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  38.1 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  28.86 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  35.18 
 
 		 302 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  32.79 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  33.77 
 
 		 315 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  28.95 
 
 		 295 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  33.77 
 
 		 315 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  33.77 
 
 		 315 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  34.95 
 
 		 317 aa  149  9e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  30.84 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  33.67 
 
 		 297 aa  145  9e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  31.91 
 
 		 309 aa  144  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  29.61 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  33.66 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  34.73 
 
 		 331 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  36.22 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  28.99 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  28.52 
 
 		 295 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  37.3 
 
 		 311 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  36.3 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  29.07 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  34.34 
 
 		 334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  30.1 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  32.71 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  33.58 
 
 		 393 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1953  protein of unknown function DUF58  33.87 
 
 		 322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534202  hitchhiker  0.00411343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  32.78 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  32.55 
 
 		 286 aa  123  5e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  31.06 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  33.05 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  27.65 
 
 		 316 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  29.21 
 
 		 323 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  32.26 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  30.32 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  26.9 
 
 		 293 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  29.45 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  30.15 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  30.45 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  26.1 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  35.12 
 
 		 335 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  30.62 
 
 		 303 aa  109  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  30.1 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  30.99 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  28 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  28.2 
 
 		 345 aa  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  30.63 
 
 		 312 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  31.56 
 
 		 310 aa  107  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  29.68 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  27.64 
 
 		 304 aa  105  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  32.43 
 
 		 334 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  33.91 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  32.76 
 
 		 322 aa  104  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  29.64 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  32.63 
 
 		 312 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  29.13 
 
 		 299 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  32.29 
 
 		 331 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  33.95 
 
 		 306 aa  102  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  31.11 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  28.66 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  33.22 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  28.45 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  30.07 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  28.91 
 
 		 318 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  28.69 
 
 		 298 aa  99.8  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  28.57 
 
 		 318 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>