238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5502 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  664    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  70.16 
 
 
311 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  60.83 
 
 
323 aa  323  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  57.28 
 
 
323 aa  317  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  57.51 
 
 
338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1953  protein of unknown function DUF58  57.37 
 
 
322 aa  296  4e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534202  hitchhiker  0.00411343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  57.28 
 
 
328 aa  290  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  56.67 
 
 
350 aa  280  3e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  50.96 
 
 
315 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  50.96 
 
 
315 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  50.96 
 
 
315 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  56.76 
 
 
331 aa  278  7e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  52.56 
 
 
316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  54.05 
 
 
302 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  55.74 
 
 
334 aa  270  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  51.35 
 
 
317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  54.4 
 
 
366 aa  265  7e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  54.06 
 
 
350 aa  264  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  50.3 
 
 
317 aa  265  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  49.49 
 
 
312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  51.41 
 
 
325 aa  250  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  46.77 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  51.23 
 
 
339 aa  242  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  50.79 
 
 
325 aa  224  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  37.37 
 
 
340 aa  189  7e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  40.79 
 
 
329 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  39.75 
 
 
328 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  40.94 
 
 
363 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  39.66 
 
 
309 aa  165  9e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  40.89 
 
 
353 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  33.76 
 
 
340 aa  159  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  34.58 
 
 
295 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  37.75 
 
 
302 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  35.35 
 
 
292 aa  146  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  27.27 
 
 
291 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  29.58 
 
 
295 aa  135  9e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  31.01 
 
 
290 aa  133  5e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  34.46 
 
 
294 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  27.11 
 
 
288 aa  129  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  25.35 
 
 
287 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  25.34 
 
 
290 aa  125  7e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  30.21 
 
 
295 aa  126  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  25.84 
 
 
287 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  35.47 
 
 
294 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  26.5 
 
 
287 aa  124  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  32.84 
 
 
418 aa  122  9e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  28.52 
 
 
328 aa  119  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  26.76 
 
 
291 aa  119  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  29.33 
 
 
297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  25.84 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  28.57 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  29.66 
 
 
292 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  25.75 
 
 
302 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  24.47 
 
 
287 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.11 
 
 
296 aa  104  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.24 
 
 
296 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  25.65 
 
 
309 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  24.91 
 
 
295 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  31.29 
 
 
287 aa  96.7  5e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  25 
 
 
296 aa  95.9  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  26.64 
 
 
286 aa  95.1  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  28.81 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  25.59 
 
 
276 aa  92.4  9e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  28.19 
 
 
293 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  26.36 
 
 
293 aa  87  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  29.83 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  28 
 
 
308 aa  84  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  25.23 
 
 
304 aa  82.4  0.000000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  26.21 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  29.33 
 
 
330 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  27.8 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  32.09 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  27.96 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  26.67 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  23.29 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  23.11 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  31.14 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  28.44 
 
 
358 aa  79.7  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  30.36 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  27.21 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  26.86 
 
 
318 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  30.09 
 
 
297 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  24.71 
 
 
298 aa  79  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  27.22 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  27.21 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  26.29 
 
 
320 aa  76.3  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  25.09 
 
 
322 aa  75.9  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  25.81 
 
 
314 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  28.01 
 
 
299 aa  75.9  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  26.95 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  31.76 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1557  hypothetical protein  29.67 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  28.62 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1608  hypothetical protein  30.04 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278109  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  29.54 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  29.26 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  29.67 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  25.78 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  27.16 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  26.98 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>