183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2180 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  605  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  66.78 
 
 
308 aa  391  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1608  hypothetical protein  65.98 
 
 
309 aa  388  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278109  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1557  hypothetical protein  66.32 
 
 
310 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3231  hypothetical protein  60.68 
 
 
320 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2276  hypothetical protein  62.24 
 
 
306 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.998635 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3057  hypothetical protein  59.52 
 
 
306 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.023452 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2793  hypothetical protein  59.52 
 
 
306 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.588603  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1008  hypothetical protein  50.91 
 
 
303 aa  293  3e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.842733  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  45.94 
 
 
318 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1375  hypothetical protein  45.58 
 
 
310 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  46.93 
 
 
312 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  47.29 
 
 
312 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  47.04 
 
 
304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1455  protein of unknown function DUF58  47.27 
 
 
304 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.296497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0915  hypothetical protein  45.85 
 
 
312 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  45.14 
 
 
313 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  46.67 
 
 
304 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  44.68 
 
 
313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2947  hypothetical protein  47.39 
 
 
324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.207971  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4481  hypothetical protein  46.1 
 
 
303 aa  229  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3636  hypothetical protein  46.07 
 
 
303 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5170  protein of unknown function DUF58  45.88 
 
 
303 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0785  protein of unknown function DUF58  43.75 
 
 
318 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2843  hypothetical protein  44.13 
 
 
312 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0724  hypothetical protein  41.16 
 
 
299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2233  hypothetical protein  36.65 
 
 
320 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2768  hypothetical protein  38.49 
 
 
302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0370  hypothetical protein  40.21 
 
 
312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361803  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  34.15 
 
 
295 aa  159  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3012  protein of unknown function DUF58  40.52 
 
 
356 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0180166  normal  0.251774 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  33.78 
 
 
300 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0204  hypothetical protein  38.63 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1023  hypothetical protein  37.41 
 
 
290 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2684  hypothetical protein  37.41 
 
 
290 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506862  normal  0.625931 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3902  hypothetical protein  34.11 
 
 
289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201945  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2006  hypothetical protein  39.91 
 
 
287 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  27.31 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  25.86 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  28.68 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  31.05 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  26.83 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  28.91 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  28.8 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  24.59 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  23.22 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  30.96 
 
 
311 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  30.6 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  27.91 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  30.22 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  22.01 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  26.74 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  29.53 
 
 
288 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  24.81 
 
 
292 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  23.44 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  25.49 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  25.29 
 
 
299 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  22.51 
 
 
298 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  24.08 
 
 
288 aa  63.5  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  25 
 
 
295 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  25.81 
 
 
302 aa  63.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  28.79 
 
 
309 aa  62.4  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  29.89 
 
 
323 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  24.06 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  27.8 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  24.89 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  30.56 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  27.75 
 
 
292 aa  60.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  30.18 
 
 
317 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  31.6 
 
 
363 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  24.48 
 
 
308 aa  60.1  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  22.42 
 
 
287 aa  60.1  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  25.93 
 
 
312 aa  59.7  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  26.51 
 
 
302 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  26.69 
 
 
302 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  25.7 
 
 
302 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  23.31 
 
 
287 aa  59.3  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  21.62 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  25 
 
 
296 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  28.24 
 
 
302 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1953  protein of unknown function DUF58  29.33 
 
 
322 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534202  hitchhiker  0.00411343 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  24.05 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  26.34 
 
 
296 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  24.44 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  31.9 
 
 
334 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  27.75 
 
 
353 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  23.96 
 
 
309 aa  57  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  26.1 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  22.57 
 
 
287 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  24.6 
 
 
296 aa  57  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  25.9 
 
 
310 aa  56.6  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  25.21 
 
 
322 aa  55.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  28.44 
 
 
306 aa  55.8  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  26.55 
 
 
294 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  24.22 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  27.89 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  28 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  23.86 
 
 
300 aa  55.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  25.35 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  21.94 
 
 
291 aa  54.3  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>