180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0204 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0204  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  566  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2684  hypothetical protein  89.66 
 
 		 290 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506862  normal  0.625931 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1023  hypothetical protein  88.97 
 
 		 290 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  59.51 
 
 		 295 aa  333  3e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  57.89 
 
 		 300 aa  326  3e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2768  hypothetical protein  59.93 
 
 		 302 aa  321  9.000000000000001e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3902  hypothetical protein  51.13 
 
 		 289 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0724  hypothetical protein  44.21 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0370  hypothetical protein  49.65 
 
 		 312 aa  201  8e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361803  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2233  hypothetical protein  42.57 
 
 		 320 aa  193  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3057  hypothetical protein  41.26 
 
 		 306 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.023452 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2793  hypothetical protein  41.26 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.588603  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0915  hypothetical protein  38.49 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3636  hypothetical protein  41.03 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  41.64 
 
 		 308 aa  179  7e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1557  hypothetical protein  41.82 
 
 		 310 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  39.65 
 
 		 318 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0785  protein of unknown function DUF58  40.91 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  40.59 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3231  hypothetical protein  39.58 
 
 		 320 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  39.56 
 
 		 313 aa  176  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2276  hypothetical protein  38.75 
 
 		 306 aa  176  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.998635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1455  protein of unknown function DUF58  40.15 
 
 		 304 aa  175  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.296497 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1608  hypothetical protein  41.16 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278109  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  40 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2843  hypothetical protein  42.45 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5170  protein of unknown function DUF58  40.45 
 
 		 303 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1375  hypothetical protein  38.01 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  38.89 
 
 		 312 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  38.52 
 
 		 312 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  39.64 
 
 		 304 aa  168  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3012  protein of unknown function DUF58  41.26 
 
 		 356 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0180166  normal  0.251774 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2947  hypothetical protein  39.47 
 
 		 324 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.207971  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  38.63 
 
 		 301 aa  165  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4481  hypothetical protein  41.97 
 
 		 303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1008  hypothetical protein  35.83 
 
 		 303 aa  159  4e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.842733  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2006  hypothetical protein  42.75 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  26.94 
 
 		 293 aa  99.4  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  26.23 
 
 		 293 aa  86.3  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  31.3 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  29.26 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  31.28 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  35.77 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  31.06 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  30.39 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  28.93 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  28.89 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  30.18 
 
 		 292 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  30 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  26.77 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  29.57 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  29.57 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1222  hypothetical protein  32 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.926333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  26.33 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  23.08 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  34.59 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  26.72 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  27.27 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  28.95 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  31.68 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  25.1 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  26.01 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  29.39 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  28.5 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  32.85 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  28.08 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  39.6 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  36.22 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  34.92 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  39 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  27.42 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  37.32 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  26.59 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  38.38 
 
 		 443 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0185  protein of unknown function DUF58  30.26 
 
 		 357 aa  55.8  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  29.69 
 
 		 353 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  28.46 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  31.08 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  38.38 
 
 		 443 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  29.29 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  31.85 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  32.05 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  29.7 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  26.47 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  27.05 
 
 		 304 aa  53.1  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  33.06 
 
 		 328 aa  52.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  26.19 
 
 		 291 aa  52.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  31.38 
 
 		 306 aa  53.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  30.32 
 
 		 312 aa  52.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  33.71 
 
 		 455 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  25.93 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  31.87 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  31 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  28.05 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  26.56 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  27.16 
 
 		 292 aa  50.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  34.91 
 
 		 428 aa  50.4  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  34.95 
 
 		 432 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  24.28 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>