More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3848 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 432 aa  847    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  45.9 
 
 		 444 aa  323  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  45.54 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  44.94 
 
 		 447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  44.42 
 
 		 429 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  47.01 
 
 		 443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  40.21 
 
 		 458 aa  306  4.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  47.01 
 
 		 443 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  45.57 
 
 		 444 aa  292  8e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  33.49 
 
 		 436 aa  220  3e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  32.59 
 
 		 440 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  27.08 
 
 		 436 aa  183  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  33.33 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  30.39 
 
 		 440 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  31.69 
 
 		 469 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  25.13 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  28.53 
 
 		 446 aa  153  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  35.87 
 
 		 444 aa  152  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  25.39 
 
 		 444 aa  152  8.999999999999999e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  27.84 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  26.68 
 
 		 448 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  26.59 
 
 		 450 aa  143  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  22.91 
 
 		 443 aa  139  7e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  31.03 
 
 		 444 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  31.6 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  35.14 
 
 		 429 aa  134  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  32.14 
 
 		 436 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  30.63 
 
 		 436 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  35.8 
 
 		 430 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  30.18 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  31.71 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  30.51 
 
 		 437 aa  105  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  31.76 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  31.36 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  28.99 
 
 		 430 aa  104  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  32.01 
 
 		 473 aa  103  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  31.14 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  30.84 
 
 		 430 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  32.71 
 
 		 433 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  32.26 
 
 		 296 aa  99.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  31.58 
 
 		 440 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  31.41 
 
 		 431 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  28.43 
 
 		 455 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  31.78 
 
 		 430 aa  93.2  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  30.61 
 
 		 454 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  31.61 
 
 		 297 aa  92.8  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  24.33 
 
 		 308 aa  90.1  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  29.33 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  30.51 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  29.05 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  29.71 
 
 		 444 aa  84  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  29.08 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  25.1 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  29.33 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  27.68 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  30.46 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  27.96 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  30.46 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  30.46 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  24.62 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  29.15 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  30.92 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  32.92 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  29.91 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  29.27 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  24.74 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  32.11 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  25.67 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  27.97 
 
 		 412 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  29.75 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  27.83 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  32.05 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  25.26 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  22.94 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  30.14 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  25.65 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  28.24 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  35.25 
 
 		 575 aa  73.6  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  29.02 
 
 		 380 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  38 
 
 		 283 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  26.48 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  30.3 
 
 		 314 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  28.83 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0193  hypothetical protein  21.35 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0000145617  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  24.56 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  24.14 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  29.05 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  25.51 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  24.23 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  26.42 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  28.11 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  26.42 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  21.96 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  30.3 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  29.55 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  26.34 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  24.89 
 
 		 304 aa  69.7  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  35.85 
 
 		 300 aa  69.7  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  31.98 
 
 		 286 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>