More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4892 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  95.94 
 
 
443 aa  784    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  100 
 
 
443 aa  877    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  68.62 
 
 
443 aa  594  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  62.3 
 
 
447 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  62.06 
 
 
429 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  62.3 
 
 
444 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  66.22 
 
 
444 aa  533  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  45.38 
 
 
458 aa  350  2e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  46.44 
 
 
432 aa  313  3.9999999999999997e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  33.26 
 
 
436 aa  204  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  28.44 
 
 
436 aa  183  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  29.43 
 
 
448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  32.07 
 
 
440 aa  180  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  31.25 
 
 
440 aa  176  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  28.05 
 
 
446 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  27.88 
 
 
450 aa  169  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  25.19 
 
 
444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  24.71 
 
 
443 aa  162  9e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  34.34 
 
 
469 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  25.53 
 
 
428 aa  161  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  28.22 
 
 
444 aa  160  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  32.14 
 
 
429 aa  152  8.999999999999999e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  31.3 
 
 
436 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  32.25 
 
 
436 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  32.54 
 
 
437 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  30.16 
 
 
428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  29.21 
 
 
430 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  31.83 
 
 
444 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  32.58 
 
 
430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  31.25 
 
 
412 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  30.39 
 
 
430 aa  116  8.999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  28.53 
 
 
444 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  31.22 
 
 
432 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  29.67 
 
 
436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  29.89 
 
 
440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  29.4 
 
 
454 aa  110  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  30.55 
 
 
434 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  32.26 
 
 
431 aa  106  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  32.4 
 
 
296 aa  104  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  30.05 
 
 
430 aa  100  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  35.94 
 
 
430 aa  99.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  26.08 
 
 
430 aa  99  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  30.05 
 
 
433 aa  96.7  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  30.17 
 
 
455 aa  96.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  31.29 
 
 
473 aa  95.9  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  26.67 
 
 
296 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  32.48 
 
 
297 aa  94.4  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  28.83 
 
 
296 aa  92.8  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  28.05 
 
 
291 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  31.87 
 
 
296 aa  88.2  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  30.08 
 
 
449 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  30.08 
 
 
449 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  28.81 
 
 
292 aa  87  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  30.59 
 
 
449 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  32.75 
 
 
441 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  29.35 
 
 
309 aa  86.7  9e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27.68 
 
 
302 aa  85.9  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  28.71 
 
 
444 aa  84.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  30.97 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  26.11 
 
 
295 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  33.08 
 
 
432 aa  82.4  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  25.56 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  26.55 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  28.06 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  32.6 
 
 
429 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  33.16 
 
 
358 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  29.61 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  33.12 
 
 
353 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  31.98 
 
 
575 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  25 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  22.99 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  30 
 
 
314 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  30.77 
 
 
314 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  26.27 
 
 
292 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  28.4 
 
 
331 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  23.08 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  22.09 
 
 
288 aa  75.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  21.85 
 
 
287 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  28.4 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  28.26 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  25.89 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  31.68 
 
 
457 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  26.95 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  34.07 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  26.95 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  32.45 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  28.24 
 
 
317 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  23.57 
 
 
287 aa  72.8  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  26.95 
 
 
318 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  25.76 
 
 
340 aa  73.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.32 
 
 
295 aa  72.4  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  27.32 
 
 
283 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  26.95 
 
 
314 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  28.35 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  32.53 
 
 
316 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  33.02 
 
 
328 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  28.52 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  28.43 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  35.34 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  26.82 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>