298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1833 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 430 aa  835    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  53.95 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  54.44 
 
 		 437 aa  365  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  48.73 
 
 		 473 aa  350  2e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  52.56 
 
 		 430 aa  343  4e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  48.54 
 
 		 412 aa  326  6e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  51.48 
 
 		 444 aa  316  4e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  46.51 
 
 		 430 aa  312  7.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  46.14 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  42.89 
 
 		 436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  46.94 
 
 		 454 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  49.19 
 
 		 430 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  48.1 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  47.58 
 
 		 433 aa  287  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  46.8 
 
 		 455 aa  286  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  44.2 
 
 		 457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  46.33 
 
 		 449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  46.33 
 
 		 449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  46.33 
 
 		 449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  47.84 
 
 		 430 aa  281  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  44.68 
 
 		 432 aa  279  8e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  47.15 
 
 		 434 aa  278  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  43.24 
 
 		 432 aa  265  2e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  44.19 
 
 		 431 aa  261  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  29.84 
 
 		 444 aa  149  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  28.95 
 
 		 436 aa  139  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  30 
 
 		 436 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  25.43 
 
 		 436 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  29.41 
 
 		 440 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  27.84 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  28.93 
 
 		 440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  23.44 
 
 		 448 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  22.73 
 
 		 428 aa  120  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  29.85 
 
 		 469 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  28.99 
 
 		 432 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  28.02 
 
 		 443 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  27.47 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  27.47 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  27.99 
 
 		 444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  29.47 
 
 		 429 aa  114  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  24.93 
 
 		 443 aa  114  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  27.15 
 
 		 436 aa  113  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  29.69 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  27.66 
 
 		 443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  24.92 
 
 		 450 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  27.06 
 
 		 443 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  29.97 
 
 		 444 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  22.63 
 
 		 444 aa  106  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  23.65 
 
 		 446 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  30.11 
 
 		 444 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  26.92 
 
 		 444 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  31.79 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  31.41 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  30.66 
 
 		 297 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  29.33 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  29.33 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  29.33 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  28.35 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  29.7 
 
 		 328 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  30.05 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  29.41 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  31.96 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  30.39 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  25.91 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  27.5 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  27.78 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.92 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  26.6 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  28.95 
 
 		 295 aa  72.8  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  29.35 
 
 		 296 aa  72.8  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  29.9 
 
 		 323 aa  72.8  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  26.4 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  28.69 
 
 		 286 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  26.06 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  28.96 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  27.89 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  26.16 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  29.41 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  29.41 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  29.32 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  27.4 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  38.06 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  35.34 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  43.33 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  23.98 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  23.08 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  36.08 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  27.39 
 
 		 286 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  32.28 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  32.28 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  42.25 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  29.23 
 
 		 308 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  39.18 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  26.46 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  46.77 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  29.36 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  37.31 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  24.4 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  48.28 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>