More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2227 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  100 
 
 
428 aa  870    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  56.31 
 
 
443 aa  490  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  50.23 
 
 
450 aa  472  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  50.36 
 
 
448 aa  442  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  50.4 
 
 
446 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  44.99 
 
 
444 aa  371  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  33.81 
 
 
436 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  31.96 
 
 
440 aa  236  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  31.34 
 
 
440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  28.85 
 
 
444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  28.34 
 
 
447 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  27.79 
 
 
429 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  26.32 
 
 
444 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  25.65 
 
 
458 aa  173  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  24.8 
 
 
444 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  25 
 
 
443 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  25.47 
 
 
443 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  25.49 
 
 
432 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  25.74 
 
 
436 aa  150  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  22.33 
 
 
436 aa  149  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  26.48 
 
 
444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  25.52 
 
 
443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  25.88 
 
 
469 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  26.71 
 
 
428 aa  133  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  25.87 
 
 
436 aa  131  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  24.52 
 
 
473 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  23.19 
 
 
437 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  25.68 
 
 
430 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  22.5 
 
 
430 aa  124  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  23.17 
 
 
436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  23.44 
 
 
432 aa  121  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  22.12 
 
 
430 aa  119  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  26.1 
 
 
430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  23.54 
 
 
431 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  22.56 
 
 
440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  24.84 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  21.89 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  22.13 
 
 
434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  21.08 
 
 
454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  21.92 
 
 
429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  22.78 
 
 
430 aa  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  23.26 
 
 
441 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  22.42 
 
 
430 aa  103  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  22.7 
 
 
432 aa  103  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  22.5 
 
 
444 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  24.32 
 
 
444 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  21.62 
 
 
455 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  24.17 
 
 
449 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  24.17 
 
 
449 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  24.17 
 
 
449 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  25.41 
 
 
419 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  22.45 
 
 
457 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  23.28 
 
 
419 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  25.83 
 
 
290 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  27.27 
 
 
303 aa  79  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  22.04 
 
 
415 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  24.31 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  24.31 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  22.88 
 
 
575 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  24.31 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  23.96 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  24.31 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  24.31 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  24.31 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  24.66 
 
 
418 aa  73.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  22.47 
 
 
404 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  22.96 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  25.83 
 
 
296 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  23.97 
 
 
442 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  24.31 
 
 
405 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  24.31 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  23.26 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  23 
 
 
426 aa  70.1  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  24.73 
 
 
362 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  27.67 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  25.66 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  27.92 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  23.81 
 
 
405 aa  67  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  23.22 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  23.05 
 
 
426 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  30.25 
 
 
302 aa  66.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  23.01 
 
 
325 aa  66.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  25.45 
 
 
309 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  21.72 
 
 
295 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  21.33 
 
 
304 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  24.26 
 
 
310 aa  64.7  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  26.83 
 
 
291 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  25.66 
 
 
296 aa  64.3  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  24.59 
 
 
384 aa  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  26.46 
 
 
297 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  26.32 
 
 
295 aa  63.9  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  23.2 
 
 
405 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  27.73 
 
 
286 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  30.93 
 
 
328 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  26.37 
 
 
564 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  25.6 
 
 
286 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  33.66 
 
 
306 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0155  hypothetical protein  21.07 
 
 
408 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  25.22 
 
 
289 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  26.11 
 
 
296 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>