More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2321 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 292 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  45.89 
 
 		 291 aa  298  8e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  46.88 
 
 		 288 aa  297  1e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  46.53 
 
 		 287 aa  298  1e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  47.93 
 
 		 290 aa  292  4e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  42.71 
 
 		 287 aa  285  9e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  42.71 
 
 		 287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  47.6 
 
 		 295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  44.79 
 
 		 302 aa  261  8e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  45.49 
 
 		 292 aa  251  9.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  47.43 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  41.87 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  45.49 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  45.83 
 
 		 296 aa  249  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  38.11 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  45.52 
 
 		 309 aa  241  9e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  42.5 
 
 		 328 aa  238  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  39.04 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  39.79 
 
 		 295 aa  229  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  41.78 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  38.73 
 
 		 287 aa  226  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  36.93 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  46.15 
 
 		 294 aa  208  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  37.77 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  44.76 
 
 		 294 aa  202  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  40.41 
 
 		 329 aa  195  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  34.95 
 
 		 296 aa  187  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  38.73 
 
 		 340 aa  186  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  41.61 
 
 		 309 aa  185  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  37.23 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  39.72 
 
 		 363 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  36.03 
 
 		 340 aa  176  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  37.85 
 
 		 328 aa  175  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  38.75 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  37.8 
 
 		 331 aa  158  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  32.35 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  37.07 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  37.76 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  30 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  35.09 
 
 		 310 aa  143  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  34.6 
 
 		 350 aa  142  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  33.56 
 
 		 312 aa  142  9e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  35.76 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  35.76 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  35.76 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  35.07 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  36.21 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  36.33 
 
 		 328 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  35.89 
 
 		 302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  33.79 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  32.09 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  32.44 
 
 		 287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  32.53 
 
 		 317 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  35.35 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  30.82 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  34.72 
 
 		 317 aa  132  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  30.53 
 
 		 291 aa  132  9e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  35.56 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  34.95 
 
 		 350 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  32.23 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  32.32 
 
 		 418 aa  126  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  32.61 
 
 		 303 aa  125  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  33.06 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  32.25 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  29.86 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  34.63 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  36.09 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  33.33 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  31.16 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  30.21 
 
 		 318 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  34.71 
 
 		 323 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  29.86 
 
 		 318 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  32.3 
 
 		 314 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  30.18 
 
 		 331 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  35.19 
 
 		 311 aa  122  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  30.69 
 
 		 299 aa  122  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  35.81 
 
 		 393 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  29.78 
 
 		 330 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  30.95 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  29.82 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  31.49 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  29.37 
 
 		 314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  34.96 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  33.84 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  35.69 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  27.95 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  27.53 
 
 		 345 aa  116  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  28.52 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  31.89 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  28.16 
 
 		 302 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  29.96 
 
 		 319 aa  112  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  30.98 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  31.38 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  31.92 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  30.41 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  30.41 
 
 		 302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  31.94 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  31.9 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  24.65 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  30.3 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>