287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2146 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 334 aa  645    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  80.46 
 
 		 317 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  69.21 
 
 		 331 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  63.76 
 
 		 315 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  63.76 
 
 		 315 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  63.76 
 
 		 315 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  59.15 
 
 		 312 aa  347  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  65.73 
 
 		 302 aa  346  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  62.54 
 
 		 317 aa  340  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  63.64 
 
 		 316 aa  341  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  56.68 
 
 		 310 aa  338  9.999999999999999e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  59.82 
 
 		 350 aa  322  5e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  57.28 
 
 		 325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  58.75 
 
 		 339 aa  294  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  55.74 
 
 		 338 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  57.19 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  56.79 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  54.52 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  54.42 
 
 		 350 aa  265  5.999999999999999e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  53.51 
 
 		 338 aa  255  8e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  51.01 
 
 		 323 aa  253  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  54.67 
 
 		 328 aa  245  6.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  53.54 
 
 		 323 aa  239  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1953  protein of unknown function DUF58  50.67 
 
 		 322 aa  237  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534202  hitchhiker  0.00411343 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  41.55 
 
 		 329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  41.2 
 
 		 328 aa  186  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  40 
 
 		 363 aa  176  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  42.62 
 
 		 353 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  41.9 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  37.59 
 
 		 295 aa  162  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  42.81 
 
 		 302 aa  162  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  35.47 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  34.04 
 
 		 340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  35.56 
 
 		 292 aa  152  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  30.88 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  28.11 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  27.82 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  30.25 
 
 		 295 aa  142  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  28.11 
 
 		 287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  28.78 
 
 		 288 aa  140  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  26.67 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  32.99 
 
 		 328 aa  135  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  34.86 
 
 		 294 aa  135  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  33.82 
 
 		 418 aa  129  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  31.48 
 
 		 290 aa  129  7.000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  35.89 
 
 		 294 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  31.49 
 
 		 295 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  36.22 
 
 		 287 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  25.5 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  27.27 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  28.82 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  28.42 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  25.83 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  26.94 
 
 		 309 aa  113  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  25.51 
 
 		 302 aa  113  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  26.71 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  26.64 
 
 		 287 aa  108  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  28.57 
 
 		 286 aa  105  8e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  26.57 
 
 		 297 aa  102  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  28.76 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  26.15 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  30.9 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  26.34 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  25.61 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  35.78 
 
 		 335 aa  96.3  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  25.1 
 
 		 293 aa  95.9  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  29.3 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  23.93 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  25.73 
 
 		 345 aa  93.2  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  27.8 
 
 		 303 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  33.5 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  28.9 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  29.68 
 
 		 288 aa  90.5  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  29.56 
 
 		 331 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  33.19 
 
 		 341 aa  89.7  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  28 
 
 		 328 aa  89.7  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  26.15 
 
 		 322 aa  89.7  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  29.06 
 
 		 330 aa  89.4  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  25.91 
 
 		 292 aa  89.4  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  28.89 
 
 		 303 aa  86.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  31.25 
 
 		 316 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  25.2 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  25.31 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  34.77 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  27.85 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  29.6 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  27.27 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  23.92 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  29 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  33.65 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  28.52 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  33.71 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  29.79 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  30.37 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  28.57 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  22.69 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  29.75 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  30.05 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  28.06 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  30.8 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>