238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3076 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
321 aa  611  9.999999999999999e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  47.81 
 
 
299 aa  259  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  46.06 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  43.71 
 
 
298 aa  242  7.999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  36.76 
 
 
358 aa  186  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  36.71 
 
 
297 aa  166  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19010  hypothetical protein  35.46 
 
 
298 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.359114  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  37.45 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  35.44 
 
 
286 aa  105  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0713  hypothetical protein  31.25 
 
 
313 aa  105  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.689852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  33 
 
 
289 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  33 
 
 
289 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  33 
 
 
289 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  27.6 
 
 
295 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  34.51 
 
 
331 aa  92.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  30.69 
 
 
302 aa  87  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  29.9 
 
 
303 aa  86.3  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  24.24 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  27.18 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  29.78 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  32.2 
 
 
310 aa  84  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  32.51 
 
 
334 aa  84  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  34.67 
 
 
436 aa  84  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  29.21 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  31.86 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  25.8 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  28.3 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  33.65 
 
 
353 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  24.14 
 
 
287 aa  82.4  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  36.67 
 
 
350 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  31.75 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  32.16 
 
 
325 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  28.48 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  25.25 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  31.71 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  31.71 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  31.71 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  34.53 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  25.58 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  36.24 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  31.64 
 
 
436 aa  80.1  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  29.72 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1988  hypothetical protein  32.12 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  32.2 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  32.51 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  22.31 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.36 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  30.53 
 
 
339 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  31.9 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  23.72 
 
 
287 aa  77  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  29.02 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  29.05 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  29.69 
 
 
446 aa  76.3  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  29 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  30.14 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  32.17 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  32.97 
 
 
428 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  21.97 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  29.95 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  26.32 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  34.74 
 
 
433 aa  73.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  28.72 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  28.42 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  32.34 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  28.07 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  26.5 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  29.95 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  33.33 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  25.98 
 
 
290 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  26.79 
 
 
340 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  35.08 
 
 
430 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  29.29 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.59 
 
 
292 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  31.73 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  29.58 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  26.8 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  26.24 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  35.43 
 
 
454 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  35.9 
 
 
431 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  26.11 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  28.72 
 
 
444 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  30.05 
 
 
291 aa  67  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  34.93 
 
 
434 aa  66.6  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  32.07 
 
 
443 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  32.86 
 
 
473 aa  66.6  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  30.22 
 
 
444 aa  66.6  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  31.52 
 
 
469 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  33.33 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  33.84 
 
 
430 aa  65.9  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  32.07 
 
 
443 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  29.65 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  30.54 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  32.45 
 
 
443 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  34.45 
 
 
302 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  22.66 
 
 
291 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  25.36 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  33.49 
 
 
432 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  27.18 
 
 
436 aa  64.7  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  25.24 
 
 
298 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>