More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1682 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  593  1e-168  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  70.73 
 
 
288 aa  439  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  69.69 
 
 
287 aa  428  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  57.49 
 
 
287 aa  359  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  54.67 
 
 
290 aa  334  1e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  54.01 
 
 
291 aa  331  9e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  46.53 
 
 
292 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  43.06 
 
 
295 aa  265  8e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  44.06 
 
 
292 aa  264  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  41.05 
 
 
291 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  46.53 
 
 
286 aa  246  3e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  45.57 
 
 
296 aa  243  3e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  42.71 
 
 
295 aa  243  3e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  40.62 
 
 
302 aa  240  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  46.9 
 
 
297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  39.37 
 
 
296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  36.36 
 
 
328 aa  232  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  41.34 
 
 
290 aa  229  3e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  40.53 
 
 
309 aa  229  5e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  38.03 
 
 
295 aa  217  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  37.1 
 
 
287 aa  212  5.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  35.92 
 
 
296 aa  205  7e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  34.97 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  37.28 
 
 
296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  36.59 
 
 
295 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  41.03 
 
 
294 aa  189  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  39.32 
 
 
294 aa  183  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  32.93 
 
 
309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  30.07 
 
 
329 aa  165  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  33.06 
 
 
328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  33.88 
 
 
363 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  32.96 
 
 
328 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  33.07 
 
 
340 aa  156  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  32.44 
 
 
340 aa  155  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  31.96 
 
 
314 aa  155  7e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  31.91 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  39.9 
 
 
393 aa  153  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  30.42 
 
 
353 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  29.38 
 
 
329 aa  145  9e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  28.42 
 
 
315 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  28.42 
 
 
315 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  27.14 
 
 
325 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  28.42 
 
 
315 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  30.22 
 
 
317 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  32.51 
 
 
291 aa  138  1e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  29.11 
 
 
314 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  28.63 
 
 
314 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  29.28 
 
 
314 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  28.9 
 
 
318 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  28.9 
 
 
318 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  27.4 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  30.34 
 
 
314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  27.72 
 
 
302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  27.62 
 
 
316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  24.14 
 
 
312 aa  129  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  33.18 
 
 
331 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  30.38 
 
 
330 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  32.71 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  25.52 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  28.96 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  26.24 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  34.03 
 
 
303 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  27.84 
 
 
312 aa  125  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  33.19 
 
 
303 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  25.8 
 
 
366 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  28.46 
 
 
324 aa  123  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  26.19 
 
 
338 aa  123  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  35.81 
 
 
312 aa  122  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  34.19 
 
 
292 aa  122  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  26.95 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  29.13 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  30.22 
 
 
345 aa  119  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  27.76 
 
 
338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  29.66 
 
 
312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  27.23 
 
 
302 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  27.62 
 
 
323 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  30.34 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  33.51 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  35.38 
 
 
310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  28.67 
 
 
323 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  29.28 
 
 
312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  26.91 
 
 
334 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  32.17 
 
 
322 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  27.4 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  28.05 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  29.95 
 
 
311 aa  113  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  28.23 
 
 
339 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  25.17 
 
 
328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  25.66 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  27.02 
 
 
350 aa  113  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  28.63 
 
 
335 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  33.33 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  26.96 
 
 
320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  32 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  27.17 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  30.52 
 
 
303 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  34.52 
 
 
317 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  35.71 
 
 
317 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  29.3 
 
 
292 aa  108  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  35.12 
 
 
317 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>