More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2441 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 294 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  89.8 
 
 		 294 aa  501  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  45.45 
 
 		 295 aa  237  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  40.7 
 
 		 291 aa  228  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  44.76 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  40.14 
 
 		 290 aa  213  3.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  37.82 
 
 		 287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  36.49 
 
 		 291 aa  211  9e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  40.85 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  35.74 
 
 		 288 aa  205  8e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  34.66 
 
 		 287 aa  202  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  37.19 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  39.32 
 
 		 287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  39.52 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  34.88 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  35.79 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  35.51 
 
 		 292 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  36.01 
 
 		 328 aa  186  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  41.1 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  35.51 
 
 		 296 aa  185  9e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  34.71 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  35.51 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  37.28 
 
 		 295 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  37.77 
 
 		 340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  36.93 
 
 		 286 aa  172  6.999999999999999e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  35.74 
 
 		 329 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  31.47 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  35.45 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  37.5 
 
 		 353 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  37.04 
 
 		 328 aa  155  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  37.76 
 
 		 363 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  31.29 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  28.93 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  33.67 
 
 		 325 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  34.75 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  33.8 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  31.01 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  35.69 
 
 		 339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  36.4 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  35.44 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  35.44 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  35.44 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  35.56 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  33.93 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  35.12 
 
 		 350 aa  136  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  31.9 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  36.27 
 
 		 316 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  37.05 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  34.8 
 
 		 325 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  37.63 
 
 		 317 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  31.8 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  36.3 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  31.69 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  31.34 
 
 		 331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  35.47 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  30.88 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  34.89 
 
 		 292 aa  122  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  35.21 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  32 
 
 		 338 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  32.76 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  33.21 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  32.82 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  32.69 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  33.7 
 
 		 318 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  33.45 
 
 		 314 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  33.7 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  32.84 
 
 		 303 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  33.09 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  32.21 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  26.16 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  31.15 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  32.92 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  33.7 
 
 		 317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  34.67 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  32.38 
 
 		 335 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  36.07 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  35.27 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  28.64 
 
 		 320 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  32.1 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  31.32 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  35.89 
 
 		 334 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  34.36 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  28.16 
 
 		 345 aa  109  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  34.18 
 
 		 314 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  34.05 
 
 		 323 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  32.26 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  30.07 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  33.45 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  35 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  31.89 
 
 		 440 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  33.03 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  33.04 
 
 		 323 aa  105  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  30.69 
 
 		 444 aa  105  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  33.71 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  32.14 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  32.97 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  32.34 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  33.5 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  29.33 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>