More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2205 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  594  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  50.35 
 
 		 295 aa  306  3e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  47.22 
 
 		 290 aa  298  7e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  42.31 
 
 		 288 aa  267  2e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  43.51 
 
 		 295 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  43.94 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  43.46 
 
 		 287 aa  263  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  41.4 
 
 		 287 aa  252  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  40.48 
 
 		 291 aa  252  6e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  41.87 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  41.05 
 
 		 287 aa  248  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  41.03 
 
 		 290 aa  245  6.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  40.14 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  43.02 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  40.77 
 
 		 295 aa  226  4e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  38.95 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  38.33 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  40.42 
 
 		 296 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  41.51 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  36.51 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  36.08 
 
 		 329 aa  205  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  38.03 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  37.41 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  34.46 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  34.71 
 
 		 296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  38.62 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  38.04 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  36.14 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  37.32 
 
 		 363 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  32.56 
 
 		 340 aa  187  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  34.15 
 
 		 295 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  35.17 
 
 		 353 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  37.55 
 
 		 287 aa  181  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  32.75 
 
 		 287 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  31.27 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  37.25 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  30.58 
 
 		 350 aa  159  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  29.24 
 
 		 325 aa  155  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  33.2 
 
 		 350 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  30.56 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  29.68 
 
 		 310 aa  152  8e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  29.76 
 
 		 418 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  29.77 
 
 		 366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  33.78 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  32.81 
 
 		 339 aa  146  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  32.81 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  28.87 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  31.31 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  28.87 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  28.87 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  32.74 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  29.89 
 
 		 276 aa  142  5e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  32.86 
 
 		 331 aa  142  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  29.43 
 
 		 302 aa  142  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  32.3 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  30.18 
 
 		 302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  29.11 
 
 		 338 aa  138  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  28.72 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  31.45 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  29.78 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  32.44 
 
 		 334 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  29.66 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  30.38 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  27.78 
 
 		 323 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  31.27 
 
 		 298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  31.62 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  31.97 
 
 		 314 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  30.58 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  29.04 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  29.88 
 
 		 328 aa  123  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  28.67 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  27.59 
 
 		 318 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  31.85 
 
 		 303 aa  122  9e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  32.96 
 
 		 303 aa  122  9e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  27.59 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  28.18 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  27.65 
 
 		 345 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  27.11 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  29.69 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  27.49 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  28.32 
 
 		 312 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  29.86 
 
 		 293 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  26.37 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  27.24 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  28.67 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  27.65 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  29.14 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  30.91 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  27.4 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  32.69 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  30.14 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  28.57 
 
 		 312 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  26.74 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  28.04 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  24.53 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  27.08 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  29.39 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  29.45 
 
 		 304 aa  108  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  26.39 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  31.46 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>