284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3844 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  614  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  60.49 
 
 		 287 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  49.32 
 
 		 296 aa  322  6e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  39.79 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  38.3 
 
 		 291 aa  219  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  38.21 
 
 		 287 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  38.03 
 
 		 287 aa  217  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  37.23 
 
 		 288 aa  209  5e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  35.92 
 
 		 287 aa  208  8e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  36.46 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  35.21 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  36.02 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  35.13 
 
 		 296 aa  191  9e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  36.4 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  37.16 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  34.17 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  34.15 
 
 		 291 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  35.05 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  31.99 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  31.93 
 
 		 295 aa  169  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  34.04 
 
 		 295 aa  169  6e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  31.01 
 
 		 329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  33.11 
 
 		 328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  34.49 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  31.36 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  28.95 
 
 		 340 aa  149  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  31.27 
 
 		 363 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  30.63 
 
 		 309 aa  142  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  30.74 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  28.76 
 
 		 295 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  31.32 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  29.64 
 
 		 294 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  31.76 
 
 		 353 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  28.93 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  30.38 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  27.21 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  32.82 
 
 		 287 aa  122  9e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  28.37 
 
 		 315 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  28.37 
 
 		 315 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  28.37 
 
 		 315 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  27.49 
 
 		 310 aa  109  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  29.2 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  27.8 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  27.02 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  28.01 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  27.41 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  27.56 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  23.05 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  25.08 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  27.47 
 
 		 317 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  27.17 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  27.36 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  28.19 
 
 		 317 aa  102  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  27.11 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  26.39 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  28.57 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  25.09 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  26.23 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  30.99 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  25 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  25.8 
 
 		 302 aa  99  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  25.61 
 
 		 310 aa  98.2  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  28.51 
 
 		 334 aa  97.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  26.69 
 
 		 350 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  27.82 
 
 		 312 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  28.03 
 
 		 310 aa  95.9  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  27.74 
 
 		 314 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  28.16 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  24.13 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  26.62 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  24.75 
 
 		 338 aa  95.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  26.67 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  24.57 
 
 		 314 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  24.49 
 
 		 318 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  27.74 
 
 		 314 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  23.31 
 
 		 331 aa  92.4  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  23.49 
 
 		 331 aa  92.4  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  24.15 
 
 		 318 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  29.52 
 
 		 335 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  26.46 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  25.52 
 
 		 314 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  29.55 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  24.41 
 
 		 350 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  22.93 
 
 		 330 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  27.82 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  26.52 
 
 		 323 aa  90.5  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  26.35 
 
 		 331 aa  90.1  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  26.48 
 
 		 312 aa  90.1  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  24.8 
 
 		 328 aa  89  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  25.54 
 
 		 329 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  27.12 
 
 		 444 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  27.57 
 
 		 345 aa  87.4  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  26.44 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  27.73 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  22.71 
 
 		 312 aa  86.7  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  23.67 
 
 		 339 aa  85.9  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  25.94 
 
 		 308 aa  85.9  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  26.01 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  27.8 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  27.8 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>