More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2088 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
296 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  66.21 
 
 
292 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  61.15 
 
 
302 aa  380  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  60.81 
 
 
296 aa  378  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  65.67 
 
 
297 aa  365  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  59.73 
 
 
309 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  42.75 
 
 
287 aa  255  5e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  45.49 
 
 
292 aa  250  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  40.85 
 
 
287 aa  249  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  40.58 
 
 
288 aa  244  9.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  45.57 
 
 
287 aa  243  3e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  40.83 
 
 
291 aa  242  6e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  46.38 
 
 
295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  42.36 
 
 
290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  41.55 
 
 
295 aa  228  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  40.42 
 
 
291 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  38.1 
 
 
328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  36.93 
 
 
290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  44.9 
 
 
286 aa  209  3e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  38.6 
 
 
295 aa  194  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  35.13 
 
 
295 aa  191  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  36.71 
 
 
287 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  35.69 
 
 
296 aa  188  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  33.1 
 
 
296 aa  186  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  34.83 
 
 
295 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  35.51 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  35.87 
 
 
294 aa  163  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  32.36 
 
 
291 aa  150  2e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  32.79 
 
 
340 aa  149  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  32.5 
 
 
314 aa  144  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  33.33 
 
 
317 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  31.17 
 
 
328 aa  142  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  29.63 
 
 
340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  31.63 
 
 
329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  33.85 
 
 
318 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  33.85 
 
 
318 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  33.97 
 
 
314 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  31.63 
 
 
328 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  32.63 
 
 
363 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  33.19 
 
 
353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  32.68 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  29.35 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  32.16 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  32.23 
 
 
309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  29.09 
 
 
330 aa  132  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  29.14 
 
 
331 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  33.08 
 
 
312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  34.02 
 
 
393 aa  125  7e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  28.7 
 
 
345 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  31.97 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  30.8 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  37.06 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  35.1 
 
 
314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  31.62 
 
 
303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  34.69 
 
 
314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  30.6 
 
 
302 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  30.25 
 
 
351 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  41.1 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  29.09 
 
 
329 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  29.3 
 
 
292 aa  115  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  30.31 
 
 
309 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  40.44 
 
 
329 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  32.09 
 
 
318 aa  113  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  28.35 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  28.05 
 
 
276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  28.11 
 
 
350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  27.84 
 
 
310 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  27.8 
 
 
320 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  29.41 
 
 
324 aa  109  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  27.89 
 
 
303 aa  108  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  33.05 
 
 
335 aa  109  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  30.62 
 
 
309 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  27.49 
 
 
303 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  30.3 
 
 
317 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  29.82 
 
 
317 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  41.55 
 
 
311 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  30.56 
 
 
312 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  29.29 
 
 
366 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2428  hypothetical protein  33.74 
 
 
309 aa  106  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0340562 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  30.52 
 
 
287 aa  106  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  29.7 
 
 
317 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  29.46 
 
 
302 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  30.16 
 
 
299 aa  105  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  27.82 
 
 
294 aa  105  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  29.92 
 
 
317 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  30.04 
 
 
322 aa  105  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  29.26 
 
 
312 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2601  hypothetical protein  30.28 
 
 
309 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  31.37 
 
 
324 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  25.83 
 
 
323 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  28.81 
 
 
317 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  27.8 
 
 
306 aa  102  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  27.24 
 
 
338 aa  102  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  27.99 
 
 
315 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  27.99 
 
 
315 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  40.98 
 
 
317 aa  102  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  27.99 
 
 
315 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2702  hypothetical protein  31.08 
 
 
307 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  28.68 
 
 
296 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  30.32 
 
 
334 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>