More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1809 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 294 aa  584  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  89.8 
 
 		 294 aa  502  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  46.85 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  46.15 
 
 		 292 aa  226  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  41.05 
 
 		 291 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  39.43 
 
 		 290 aa  211  9e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  38.04 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  36.82 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  38.55 
 
 		 287 aa  209  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  35.74 
 
 		 287 aa  206  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  40.49 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  41.03 
 
 		 287 aa  205  7e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  40.32 
 
 		 295 aa  202  7e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  37.89 
 
 		 296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  35.23 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  36.33 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  41.55 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  35.92 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  37.99 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  38.33 
 
 		 286 aa  185  1.0000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  35.87 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  35.51 
 
 		 292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  35.38 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  34.71 
 
 		 290 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  36.43 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  31.82 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  37.22 
 
 		 340 aa  169  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  35.18 
 
 		 340 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  37.2 
 
 		 328 aa  162  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  38.19 
 
 		 353 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  37.06 
 
 		 363 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  36.49 
 
 		 339 aa  152  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  29.64 
 
 		 295 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  30.94 
 
 		 287 aa  148  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  34.28 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  36.52 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  34.8 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  36.14 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  36.14 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  36.14 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  35.45 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  36.49 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  35.56 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  39.11 
 
 		 302 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  39.56 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  35.69 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  34.67 
 
 		 338 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  38.25 
 
 		 317 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  38.15 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  32.74 
 
 		 418 aa  134  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  35 
 
 		 328 aa  132  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  28.41 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  29.97 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  36.62 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  36.6 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  34.46 
 
 		 338 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  28.32 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  33.79 
 
 		 366 aa  125  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  27.97 
 
 		 331 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  35.39 
 
 		 309 aa  124  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  32.69 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  33.59 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  34.2 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  27.97 
 
 		 330 aa  123  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  35.16 
 
 		 314 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  30.58 
 
 		 329 aa  122  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  34.19 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  34.19 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  30 
 
 		 345 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  33.9 
 
 		 350 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  34.56 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  36.56 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  32.84 
 
 		 302 aa  116  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  33.7 
 
 		 317 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  33.21 
 
 		 303 aa  115  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  26.88 
 
 		 276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  27.41 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  33.18 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  34.86 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  32.38 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  36.1 
 
 		 312 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  31.79 
 
 		 335 aa  112  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  34.07 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  32.26 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  34.43 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  33.09 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  36.36 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  32.38 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  32.34 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  36.02 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  34.69 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  35.16 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  31.75 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  35.09 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  31.97 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  30.69 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  33.48 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  30.04 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  29.43 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  37.56 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>