295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2405 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 312 aa  616  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  67.21 
 
 		 315 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  67.21 
 
 		 315 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  67.21 
 
 		 315 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  65.46 
 
 		 316 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  67.33 
 
 		 317 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  66.33 
 
 		 302 aa  378  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  59.48 
 
 		 310 aa  373  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  60.19 
 
 		 317 aa  341  9e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  61.46 
 
 		 331 aa  330  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  59.15 
 
 		 334 aa  316  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  57.34 
 
 		 350 aa  295  7e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  50 
 
 		 325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  53 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  53.33 
 
 		 325 aa  262  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  49.49 
 
 		 338 aa  251  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  48.99 
 
 		 350 aa  251  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  51.58 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  51.71 
 
 		 366 aa  249  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  51.17 
 
 		 338 aa  248  9e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  51.38 
 
 		 323 aa  239  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  50.17 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  46.42 
 
 		 323 aa  233  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1953  protein of unknown function DUF58  47.84 
 
 		 322 aa  222  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534202  hitchhiker  0.00411343 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  38.51 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  35.26 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  40.97 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  30.56 
 
 		 291 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  34.83 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  35.92 
 
 		 309 aa  159  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  37.1 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  33.45 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  37.68 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  33.12 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  27.3 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  27.02 
 
 		 288 aa  147  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  33.56 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  26.55 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  27.3 
 
 		 290 aa  142  8e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  29.21 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  35.56 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  24.14 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  27.24 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  35.56 
 
 		 294 aa  132  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  33.11 
 
 		 295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  34.53 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  29.73 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  31.43 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  33.67 
 
 		 418 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.05 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  25.94 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  25.46 
 
 		 296 aa  115  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  30.95 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  24.14 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  29.26 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  26.39 
 
 		 296 aa  109  6e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.63 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  32.07 
 
 		 292 aa  106  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  25.17 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  27.06 
 
 		 345 aa  102  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  24.53 
 
 		 293 aa  102  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  32.39 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  30.89 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  24.91 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  26.46 
 
 		 293 aa  99.4  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  27.96 
 
 		 288 aa  96.3  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  22.97 
 
 		 287 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  28.85 
 
 		 309 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  28.5 
 
 		 314 aa  93.2  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  34.05 
 
 		 341 aa  92.8  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  29.67 
 
 		 303 aa  92.4  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  29.67 
 
 		 303 aa  92.4  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  31.01 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  28.91 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  28.68 
 
 		 316 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  23 
 
 		 295 aa  89.4  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  29.53 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  23.11 
 
 		 291 aa  86.7  5e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  30.82 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  23.55 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  29.96 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  24.33 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  28.86 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  27.91 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  25.61 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  29.19 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  31.19 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  25.68 
 
 		 306 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  28.12 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  28.15 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  28.52 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  27.35 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  27.97 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  30.47 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  26.9 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  23.08 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  25.22 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  25.5 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  27.51 
 
 		 331 aa  79  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>