264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1796 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  597  1e-169  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  70.16 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  63.51 
 
 		 323 aa  317  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  58.36 
 
 		 323 aa  315  5e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  60.13 
 
 		 338 aa  302  6.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1953  protein of unknown function DUF58  57.48 
 
 		 322 aa  290  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534202  hitchhiker  0.00411343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  60.54 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  58.39 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  52.61 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  52.54 
 
 		 317 aa  270  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  52.61 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  52.61 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  57.39 
 
 		 350 aa  269  5e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  53.31 
 
 		 316 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  54.7 
 
 		 317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  53.31 
 
 		 302 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  57.24 
 
 		 334 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  56.25 
 
 		 366 aa  263  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  51.58 
 
 		 312 aa  258  8e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  58.28 
 
 		 350 aa  257  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  53.57 
 
 		 339 aa  252  5.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  51.23 
 
 		 310 aa  249  5e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  50.34 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  54.72 
 
 		 325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  45.12 
 
 		 329 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  37.87 
 
 		 340 aa  170  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  45.61 
 
 		 363 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  43.91 
 
 		 353 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  43.62 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  42.09 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  36.04 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  35.37 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  28.07 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  27.05 
 
 		 287 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  26.71 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  35.19 
 
 		 292 aa  135  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  37.32 
 
 		 302 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  31.06 
 
 		 295 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  26.5 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  29.2 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  25.17 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  28.12 
 
 		 290 aa  123  5e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  24.19 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  34.04 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  26.87 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27.24 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  35.59 
 
 		 418 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  24.45 
 
 		 291 aa  112  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  24.74 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  28.32 
 
 		 296 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  32.86 
 
 		 294 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  28.15 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  28.62 
 
 		 296 aa  107  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  26.78 
 
 		 328 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  26.46 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  26.99 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  24.18 
 
 		 287 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  26.76 
 
 		 293 aa  96.7  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  26.64 
 
 		 286 aa  96.3  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  26.87 
 
 		 293 aa  95.9  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  26.12 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  25.94 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  25.32 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  29.57 
 
 		 287 aa  91.3  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  30.6 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  29.18 
 
 		 304 aa  90.1  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  24.69 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  31.34 
 
 		 331 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  30.88 
 
 		 331 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  30.88 
 
 		 330 aa  86.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  32.22 
 
 		 314 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  29.89 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  27.11 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  32.07 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  31.65 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  30.65 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  28.48 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  31.16 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  29.3 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  32.11 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  25.87 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  28.77 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  32.51 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  25.54 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  26.85 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  27.24 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  27.1 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  27.17 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  31.63 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  25.5 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  28.77 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  26.8 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  29.41 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  27.49 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  28.57 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  33.83 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  31.16 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  29.33 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  28.22 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>