More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2989 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  717    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  40.91 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  35.53 
 
 		 320 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  35.5 
 
 		 316 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  37.62 
 
 		 341 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  38.39 
 
 		 320 aa  222  9e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  35.84 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  38.59 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  37.27 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  33.44 
 
 		 312 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  38.54 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  35.16 
 
 		 331 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  31.6 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  34.74 
 
 		 311 aa  182  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  32.48 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  36.84 
 
 		 306 aa  171  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  31.58 
 
 		 303 aa  169  7e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  34.56 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  30.59 
 
 		 303 aa  166  8e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  29.45 
 
 		 317 aa  166  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  29.28 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  28.99 
 
 		 314 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  28.95 
 
 		 318 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  28.99 
 
 		 314 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  33.88 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  30.1 
 
 		 314 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  29.71 
 
 		 312 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  32.59 
 
 		 312 aa  155  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  32.91 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  33.22 
 
 		 351 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  29.84 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  29.64 
 
 		 312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  28.99 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  33.99 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  29.61 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  31.65 
 
 		 317 aa  149  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  31.07 
 
 		 318 aa  149  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  31.29 
 
 		 317 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  30.94 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  30.94 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  33.46 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  31.02 
 
 		 317 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  32.63 
 
 		 319 aa  145  8.000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  31.01 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  38.11 
 
 		 310 aa  143  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  32.03 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  30.46 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  30.92 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  29.96 
 
 		 295 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2428  hypothetical protein  32.98 
 
 		 309 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0340562 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3091  hypothetical protein  30.6 
 
 		 327 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2601  hypothetical protein  32.73 
 
 		 309 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1527  hypothetical protein  31.67 
 
 		 311 aa  138  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1405  hypothetical protein  31.91 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000755973 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1470  hypothetical protein  31.91 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  28.03 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1458  hypothetical protein  32.89 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000087198 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  29.26 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  27.78 
 
 		 295 aa  126  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  28.7 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  28.83 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  31.43 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  30.12 
 
 		 290 aa  124  4e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  26.07 
 
 		 328 aa  122  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  27.49 
 
 		 287 aa  122  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  29.26 
 
 		 295 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  27.34 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  27.65 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  35.16 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  25.43 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  30.22 
 
 		 287 aa  119  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  29.92 
 
 		 287 aa  119  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  28.89 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  28.18 
 
 		 329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  25.72 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  27.53 
 
 		 292 aa  116  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  27.98 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  35.1 
 
 		 291 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  25.83 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  26.83 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  37.5 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  28.2 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2471  protein of unknown function DUF58  33.54 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  30 
 
 		 294 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  29.15 
 
 		 309 aa  104  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  28.23 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  26.58 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  26.58 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  25.84 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  26.58 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  24.4 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  26.95 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  29.66 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  28.2 
 
 		 316 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0457  protein of unknown function DUF58  33.14 
 
 		 302 aa  97.8  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  26.97 
 
 		 317 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0049  protein of unknown function DUF58  35.46 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.799483  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  26.1 
 
 		 290 aa  97.4  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  28.57 
 
 		 325 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  28.57 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>