More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4164 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 295 aa  608  1e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  36.23 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  33.91 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  32.34 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  32.98 
 
 		 299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  33.22 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  31.89 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  32.87 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  32.87 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  29.27 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  29.9 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  30.93 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  30.2 
 
 		 298 aa  145  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  28.08 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  30.1 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  25.26 
 
 		 308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  27.18 
 
 		 308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  25.43 
 
 		 293 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  24.64 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  32.88 
 
 		 303 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  25.34 
 
 		 309 aa  115  6.9999999999999995e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  25.61 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  26.92 
 
 		 298 aa  108  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  28.79 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  26.99 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  26.04 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  30.96 
 
 		 283 aa  99  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  24.57 
 
 		 291 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  25.77 
 
 		 284 aa  98.6  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  27.01 
 
 		 292 aa  96.3  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  28.18 
 
 		 295 aa  94.7  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  25.26 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  26.2 
 
 		 340 aa  94.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  25.17 
 
 		 296 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  27.27 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  25.68 
 
 		 291 aa  93.2  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3012  protein of unknown function DUF58  28.73 
 
 		 356 aa  93.2  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0180166  normal  0.251774 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  29.41 
 
 		 296 aa  92.4  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  29.77 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2702  hypothetical protein  31.94 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  24.55 
 
 		 290 aa  90.1  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  25.27 
 
 		 295 aa  89.7  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.51 
 
 		 295 aa  89.4  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27.24 
 
 		 302 aa  89.4  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  24.92 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1974  hypothetical protein  30.51 
 
 		 307 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  25 
 
 		 340 aa  88.2  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  23.36 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  24.59 
 
 		 288 aa  87.4  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  25.6 
 
 		 294 aa  86.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0043  hypothetical protein  25.43 
 
 		 288 aa  86.3  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  22.46 
 
 		 287 aa  86.3  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  29.01 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  31.67 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  32.13 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  25.83 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  27.8 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  22.76 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  24.14 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  22.51 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1008  hypothetical protein  23.84 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.842733  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  20.8 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  26.74 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  22.4 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  26.37 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0823  protein of unknown function DUF58  24.91 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  23.81 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  22.46 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  28 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2276  hypothetical protein  22.79 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.998635 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  26.61 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  22 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1455  protein of unknown function DUF58  29.09 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.296497 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  23.81 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  26.2 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  22.61 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1608  hypothetical protein  24.72 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  26.18 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1557  hypothetical protein  26.98 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  26.98 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4481  hypothetical protein  25 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0785  protein of unknown function DUF58  26.83 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  28.32 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3636  hypothetical protein  27.85 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  24.09 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  24.45 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  28.52 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  27.31 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  22.51 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  27.31 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  27.31 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  28.64 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  27.19 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  28.26 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2233  hypothetical protein  24.82 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  23.66 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  28.92 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  25.11 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5170  protein of unknown function DUF58  31.2 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  28.95 
 
 		 436 aa  65.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>