142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2233 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2233  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  640    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0724  hypothetical protein  46.6 
 
 		 299 aa  243  5e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0785  protein of unknown function DUF58  48.26 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0370  hypothetical protein  49.32 
 
 		 312 aa  231  9e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361803  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  41.67 
 
 		 313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1455  protein of unknown function DUF58  42.91 
 
 		 304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.296497 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3231  hypothetical protein  42.25 
 
 		 320 aa  219  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  43.1 
 
 		 304 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  43.1 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3636  hypothetical protein  43.86 
 
 		 303 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4481  hypothetical protein  46.64 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2793  hypothetical protein  41.02 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.588603  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3057  hypothetical protein  41.13 
 
 		 306 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.023452 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  41.02 
 
 		 313 aa  212  9e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  41.18 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2276  hypothetical protein  40.47 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.998635 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5170  protein of unknown function DUF58  43.92 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  39.6 
 
 		 312 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  39.4 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1557  hypothetical protein  39.53 
 
 		 310 aa  209  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1608  hypothetical protein  39.36 
 
 		 309 aa  209  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278109  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  38.74 
 
 		 312 aa  208  9e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0915  hypothetical protein  39.1 
 
 		 312 aa  208  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2947  hypothetical protein  45.36 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.207971  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  39.86 
 
 		 295 aa  206  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1375  hypothetical protein  38.14 
 
 		 310 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1008  hypothetical protein  36.04 
 
 		 303 aa  202  8e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.842733  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  36.65 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3012  protein of unknown function DUF58  40.07 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0180166  normal  0.251774 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1023  hypothetical protein  41.98 
 
 		 290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  38.36 
 
 		 300 aa  189  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0204  hypothetical protein  42.57 
 
 		 290 aa  188  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2684  hypothetical protein  41.64 
 
 		 290 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506862  normal  0.625931 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2843  hypothetical protein  42.27 
 
 		 312 aa  185  7e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2768  hypothetical protein  37.83 
 
 		 302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3902  hypothetical protein  40.36 
 
 		 289 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2006  hypothetical protein  41.28 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  25.81 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  27.95 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  27.27 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  28.4 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  26.98 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  24.56 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  28 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  28.21 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  25.99 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  26.67 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  25.58 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  27.9 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  28.47 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  26.48 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  28.62 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  23.91 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  36.97 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  29.44 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  24.56 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  29.81 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  25.28 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  27.1 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  26.98 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  26.98 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  26.98 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  27.63 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  39.19 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  27.86 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  26.67 
 
 		 429 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  26.62 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  29.08 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  26.43 
 
 		 302 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  24.44 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  25.65 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  25.13 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  22.34 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  26.8 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  25.91 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  30.95 
 
 		 443 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  24.44 
 
 		 297 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  26.51 
 
 		 432 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  26.22 
 
 		 447 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  32.31 
 
 		 444 aa  53.1  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  23.19 
 
 		 291 aa  53.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  30.22 
 
 		 444 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  24.51 
 
 		 340 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  25.1 
 
 		 295 aa  53.1  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  24.42 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  26.51 
 
 		 353 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  23.85 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  31.31 
 
 		 443 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  22.51 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  29.38 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  30.7 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  29.36 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  30.43 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  30.3 
 
 		 444 aa  50.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2702  hypothetical protein  27.83 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  31.31 
 
 		 443 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  23.55 
 
 		 296 aa  50.4  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  23.27 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  26.64 
 
 		 309 aa  50.1  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  31.54 
 
 		 436 aa  50.1  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>