208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2905 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  608  1e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  68.4 
 
 		 295 aa  411  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2684  hypothetical protein  58.25 
 
 		 290 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506862  normal  0.625931 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1023  hypothetical protein  57.54 
 
 		 290 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0204  hypothetical protein  57.89 
 
 		 290 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2768  hypothetical protein  51.03 
 
 		 302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3902  hypothetical protein  48.5 
 
 		 289 aa  225  8e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2843  hypothetical protein  41.79 
 
 		 312 aa  189  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0785  protein of unknown function DUF58  39.08 
 
 		 318 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  38.55 
 
 		 304 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0370  hypothetical protein  40.56 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361803  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0724  hypothetical protein  39.72 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3057  hypothetical protein  37.77 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.023452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  38.18 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2233  hypothetical protein  38.36 
 
 		 320 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2793  hypothetical protein  37.05 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.588603  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3012  protein of unknown function DUF58  38.97 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0180166  normal  0.251774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1455  protein of unknown function DUF58  36.21 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.296497 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3636  hypothetical protein  36.82 
 
 		 303 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0915  hypothetical protein  36.86 
 
 		 312 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  36.1 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3231  hypothetical protein  35.23 
 
 		 320 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2276  hypothetical protein  34.46 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.998635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  35.11 
 
 		 312 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  35.23 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  35.84 
 
 		 318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  35.38 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5170  protein of unknown function DUF58  36.84 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  36.52 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1557  hypothetical protein  36.9 
 
 		 310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1608  hypothetical protein  36.73 
 
 		 309 aa  162  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278109  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1375  hypothetical protein  33.45 
 
 		 310 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4481  hypothetical protein  37.45 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1008  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.842733  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  33.78 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2947  hypothetical protein  36.57 
 
 		 324 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.207971  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2006  hypothetical protein  38.64 
 
 		 287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  29.06 
 
 		 309 aa  89.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.99 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  31.2 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  28.42 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  30.53 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  26.46 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  30.15 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  21.97 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  25.99 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  30.89 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  25.94 
 
 		 303 aa  75.5  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  21.51 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  28.68 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  25 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  28.68 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  28.3 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  27.13 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  29.44 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  25.1 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  26.42 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  27.44 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.27 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  28.5 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  28.78 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  29.08 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  26.94 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  26.36 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  28 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  27.75 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  27.6 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  31.85 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  32.2 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  28.8 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  25.48 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  24.3 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  27.2 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  31.01 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  26.4 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  34.81 
 
 		 455 aa  62  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  24.91 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  30.38 
 
 		 443 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  26.03 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  24.62 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  27.54 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1282  protein of unknown function DUF58  31.55 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0117849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  28.47 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  30.37 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  28.71 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  25.6 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0185  protein of unknown function DUF58  27.37 
 
 		 357 aa  58.9  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  22.13 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  30.05 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  30.14 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  24.28 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  29.45 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  32.48 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  32.69 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  26.43 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  29.45 
 
 		 444 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  28.65 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  28.34 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  24.64 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  30.94 
 
 		 444 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>