119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2768 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2768  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2684  hypothetical protein  59.93 
 
 		 290 aa  315  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506862  normal  0.625931 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1023  hypothetical protein  59.57 
 
 		 290 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0204  hypothetical protein  59.93 
 
 		 290 aa  297  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  52 
 
 		 295 aa  290  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  51.03 
 
 		 300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0370  hypothetical protein  46.81 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361803  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3902  hypothetical protein  46.24 
 
 		 289 aa  200  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0724  hypothetical protein  41.55 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2276  hypothetical protein  37.15 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.998635 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0785  protein of unknown function DUF58  42.32 
 
 		 318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  39.05 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  38.69 
 
 		 313 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  38.75 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1375  hypothetical protein  38.41 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3231  hypothetical protein  35.92 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  39.05 
 
 		 308 aa  176  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  38.99 
 
 		 312 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_004310  BR1557  hypothetical protein  39.11 
 
 		 310 aa  175  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0915  hypothetical protein  37.68 
 
 		 312 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2793  hypothetical protein  37.5 
 
 		 306 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.588603  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3057  hypothetical protein  37.5 
 
 		 306 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.023452 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  37.05 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  38.49 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1608  hypothetical protein  37.92 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278109  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2233  hypothetical protein  37.17 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1455  protein of unknown function DUF58  37.63 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.296497 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  37.63 
 
 		 304 aa  169  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2843  hypothetical protein  40.69 
 
 		 312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  37.37 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3636  hypothetical protein  37.92 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2947  hypothetical protein  36.94 
 
 		 324 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.207971  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3012  protein of unknown function DUF58  40.52 
 
 		 356 aa  159  8e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0180166  normal  0.251774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5170  protein of unknown function DUF58  40.08 
 
 		 303 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1008  hypothetical protein  31.39 
 
 		 303 aa  152  5e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.842733  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4481  hypothetical protein  39.37 
 
 		 303 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2006  hypothetical protein  42.45 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  24.56 
 
 		 293 aa  86.7  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  25.09 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  26.3 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  32.02 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  26.1 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  25.6 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  29.35 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.65 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  28.81 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  31.65 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  27.94 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0185  protein of unknown function DUF58  26.71 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  23.83 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  23.91 
 
 		 284 aa  57  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  22.96 
 
 		 287 aa  57  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  24.71 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  23.6 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  25 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  27.16 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  37.39 
 
 		 432 aa  53.1  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  24.08 
 
 		 309 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  25.68 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  28.35 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  27.74 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  28.21 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  26.04 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  27.88 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  28.21 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  26.85 
 
 		 297 aa  50.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  25.72 
 
 		 296 aa  49.3  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  25.47 
 
 		 287 aa  49.3  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  28.93 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  25 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  30.33 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  23.7 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  26.05 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  26.94 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  26.82 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  32.84 
 
 		 444 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  31.11 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  35.64 
 
 		 428 aa  47.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  23.92 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  26.98 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  26.84 
 
 		 319 aa  47  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  32.77 
 
 		 443 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  30.97 
 
 		 458 aa  46.2  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  33.87 
 
 		 575 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  32.59 
 
 		 328 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  28.48 
 
 		 447 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  29.14 
 
 		 429 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  26.69 
 
 		 436 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  22.59 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  31.93 
 
 		 443 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  25.95 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  25.17 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  24.89 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  31.31 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  23.3 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  34.34 
 
 		 444 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  27.6 
 
 		 393 aa  43.9  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  28.03 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  23.85 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  28.95 
 
 		 320 aa  43.5  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>