254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0185 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0185  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
357 aa  727    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  29.46 
 
 
304 aa  92  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  26.89 
 
 
288 aa  90.5  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  29.84 
 
 
312 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  31.94 
 
 
314 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  31.48 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  31.02 
 
 
314 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  31.48 
 
 
318 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  27.48 
 
 
290 aa  85.9  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  31.02 
 
 
317 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  25.28 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  30.43 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  29.95 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  29.7 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  28.45 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  28.99 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  23.97 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  27.95 
 
 
393 aa  83.2  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  27.31 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  31.12 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  26.27 
 
 
287 aa  82  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  26.89 
 
 
287 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  25.47 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  32.87 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  29.9 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  28.93 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  33.79 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  28.19 
 
 
324 aa  79.7  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  28.99 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  30.77 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  31.28 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  29.03 
 
 
340 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  25.37 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  28.82 
 
 
353 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  28.16 
 
 
292 aa  77  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  32.83 
 
 
335 aa  77  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  29.3 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  29.22 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  26.36 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  32.64 
 
 
329 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  26.75 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  25.94 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  28 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  40.51 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  24.91 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.39 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  23.6 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  27.88 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  28.28 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  30.96 
 
 
341 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.67 
 
 
296 aa  72.4  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  24.23 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  24.73 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  24.56 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  26.27 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  26.82 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  38.71 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  29.74 
 
 
294 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  23.53 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  27.23 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  29.18 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  27.85 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  26.69 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  26.34 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  29.05 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  27.22 
 
 
303 aa  67  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  27.6 
 
 
295 aa  67  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  37.5 
 
 
331 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  37.5 
 
 
331 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  37.5 
 
 
330 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  35.29 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  30.74 
 
 
350 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  39.53 
 
 
309 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  29.65 
 
 
309 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  25.76 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  24.63 
 
 
293 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  30.35 
 
 
313 aa  63.5  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  25.99 
 
 
334 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  25.47 
 
 
303 aa  63.2  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  40.62 
 
 
311 aa  63.2  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  27.42 
 
 
292 aa  63.2  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  38.27 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  24.88 
 
 
320 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0049  protein of unknown function DUF58  34.71 
 
 
331 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.799483  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  25.62 
 
 
314 aa  62  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  40.54 
 
 
320 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  28.83 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  25 
 
 
287 aa  62  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2684  hypothetical protein  30.63 
 
 
290 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506862  normal  0.625931 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1023  hypothetical protein  30.63 
 
 
290 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  21.15 
 
 
295 aa  61.2  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  39.47 
 
 
311 aa  60.5  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  38.16 
 
 
318 aa  60.1  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  30.85 
 
 
318 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3012  protein of unknown function DUF58  30.43 
 
 
356 aa  60.1  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0180166  normal  0.251774 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  24.76 
 
 
308 aa  60.1  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  27.01 
 
 
317 aa  59.3  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0254  hypothetical protein  30.17 
 
 
446 aa  59.3  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  27.01 
 
 
317 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  34.88 
 
 
317 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>