More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2679 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  635    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  72.55 
 
 		 317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  71.34 
 
 		 317 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1527  hypothetical protein  76.3 
 
 		 311 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  70.68 
 
 		 317 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  71.01 
 
 		 317 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  71.01 
 
 		 317 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3091  hypothetical protein  72.96 
 
 		 327 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  68.2 
 
 		 309 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1405  hypothetical protein  74.83 
 
 		 322 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000755973 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  66.12 
 
 		 309 aa  443  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1470  hypothetical protein  74.5 
 
 		 322 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1458  hypothetical protein  74.16 
 
 		 322 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000087198 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2428  hypothetical protein  70.92 
 
 		 309 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0340562 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2601  hypothetical protein  64.63 
 
 		 309 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  62.95 
 
 		 318 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  42.07 
 
 		 351 aa  219  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  41.82 
 
 		 323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  39.29 
 
 		 324 aa  209  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  41.87 
 
 		 319 aa  189  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  36.36 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  41.41 
 
 		 322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  38.34 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  37.94 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  37.31 
 
 		 318 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  37 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  38.08 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  38.52 
 
 		 314 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  39.09 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  44.28 
 
 		 314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  36.02 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  37.97 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  38.28 
 
 		 393 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  43.92 
 
 		 314 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  40.91 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  36.33 
 
 		 312 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  36.58 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  40 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  31.67 
 
 		 345 aa  152  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  40.27 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  35.75 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  38.87 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  37.96 
 
 		 324 aa  142  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  31.09 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  35.59 
 
 		 335 aa  132  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  29.2 
 
 		 334 aa  132  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  33.45 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  33.46 
 
 		 331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  33.46 
 
 		 331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  36.15 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  33.46 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  34.08 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  32.62 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  38.07 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  29.6 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  29.53 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  30.37 
 
 		 320 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  40.1 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  32.26 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  31.62 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  29.95 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  26.91 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  29.96 
 
 		 297 aa  112  9e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  36.42 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  43.31 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  33.14 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0457  protein of unknown function DUF58  32.81 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1005  protein of unknown function DUF58  30.77 
 
 		 322 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0328767  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  32.65 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  41.55 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.27 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  30.77 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  28.72 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  39.68 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  42.4 
 
 		 292 aa  102  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  28.34 
 
 		 340 aa  102  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2471  protein of unknown function DUF58  28.15 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  47.32 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  29.25 
 
 		 295 aa  100  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  30.88 
 
 		 291 aa  98.2  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1384  hypothetical protein  31.6 
 
 		 306 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  31.21 
 
 		 295 aa  96.7  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  31.55 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  30.52 
 
 		 336 aa  93.6  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0863  hypothetical protein  33.33 
 
 		 309 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0448863  normal  0.0441137 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  26.53 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1735  hypothetical protein  34.78 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.548655  normal  0.740515 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  31.62 
 
 		 294 aa  89  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  31.68 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  29.11 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0822  hypothetical protein  32.89 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.292102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  29.57 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  39.31 
 
 		 329 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0049  protein of unknown function DUF58  40.2 
 
 		 331 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.799483  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  30.81 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  29.21 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0789  hypothetical protein  32.08 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  0.025632 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  31.91 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  27.91 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  36.51 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>