199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2471 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2471  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 319 aa  626  1e-178  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0863  hypothetical protein  48.98 
 
 		 309 aa  229  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0448863  normal  0.0441137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0822  hypothetical protein  48.98 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.292102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0789  hypothetical protein  48.12 
 
 		 310 aa  209  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  0.025632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1005  protein of unknown function DUF58  50.85 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0328767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1384  hypothetical protein  48.45 
 
 		 306 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4307  hypothetical protein  46.76 
 
 		 297 aa  193  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0981315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0457  protein of unknown function DUF58  39.66 
 
 		 302 aa  168  9e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4009  hypothetical protein  43.95 
 
 		 283 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0352692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3276  hypothetical protein  43.55 
 
 		 283 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345093  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  33.6 
 
 		 328 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  37.95 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  31.17 
 
 		 303 aa  113  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  26.91 
 
 		 320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  30.3 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  30.42 
 
 		 331 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  29.8 
 
 		 317 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  30.42 
 
 		 331 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  30 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  33.92 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  33.54 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  37.16 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  37.95 
 
 		 393 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  36.24 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  31.47 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  34.21 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  29.51 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  37.74 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1126  hypothetical protein  39.69 
 
 		 232 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  33.05 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  28 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  31.93 
 
 		 317 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  31.93 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  34.48 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  26.27 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  35.54 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  36.71 
 
 		 335 aa  97.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  34.34 
 
 		 309 aa  97.4  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  35.2 
 
 		 329 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  37.4 
 
 		 322 aa  96.7  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  31.51 
 
 		 317 aa  96.3  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  22.15 
 
 		 319 aa  95.9  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  32.72 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  37.98 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  41.09 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  32.92 
 
 		 314 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  32.92 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  38.17 
 
 		 351 aa  92.8  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  36.03 
 
 		 308 aa  92.8  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3091  hypothetical protein  29.08 
 
 		 327 aa  92.4  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  37.04 
 
 		 312 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  32.3 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  31.14 
 
 		 317 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  36.59 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  32.1 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  32.1 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  34.15 
 
 		 324 aa  89.7  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2428  hypothetical protein  31.27 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0340562 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  28.57 
 
 		 304 aa  86.7  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  31.53 
 
 		 340 aa  86.3  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  35.1 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1405  hypothetical protein  30.99 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000755973 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1470  hypothetical protein  28.97 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1458  hypothetical protein  28.97 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000087198 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2601  hypothetical protein  29.33 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  32.23 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  37.25 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  26.15 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  26.97 
 
 		 312 aa  79  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  43.48 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1527  hypothetical protein  32.49 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  38.79 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  23.91 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  34.08 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  32.67 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  30.63 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  41.76 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  36.44 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  29.11 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  36.29 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  23.83 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  25.49 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  37.93 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  33.86 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  28.29 
 
 		 291 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  35.34 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  24.34 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  37.59 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  30.71 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  27.12 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  33.14 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  30.67 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  44.93 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  32.28 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  27.34 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  23.93 
 
 		 287 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  31.91 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  37.59 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  31.34 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  30.41 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>