276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3234 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
309 aa  600  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  66.55 
 
 
320 aa  340  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  35.42 
 
 
303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  35.76 
 
 
303 aa  166  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  36.9 
 
 
309 aa  153  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  38.06 
 
 
309 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  34.05 
 
 
328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  38.59 
 
 
317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2601  hypothetical protein  37.15 
 
 
309 aa  143  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  38.7 
 
 
317 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  40.83 
 
 
314 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  39.47 
 
 
318 aa  143  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  39.13 
 
 
317 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  38.56 
 
 
311 aa  142  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  39.3 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  38.4 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  41.35 
 
 
314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  41.35 
 
 
318 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  37.73 
 
 
393 aa  140  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  41.35 
 
 
318 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  32.26 
 
 
304 aa  139  8.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  34.73 
 
 
323 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  39.24 
 
 
317 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1527  hypothetical protein  40.68 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  38.77 
 
 
351 aa  136  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3091  hypothetical protein  39.74 
 
 
327 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  40.65 
 
 
314 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  37.34 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1405  hypothetical protein  39.74 
 
 
322 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000755973 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1470  hypothetical protein  39.74 
 
 
322 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1458  hypothetical protein  39.74 
 
 
322 aa  133  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000087198 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  33.2 
 
 
322 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  39.72 
 
 
314 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2428  hypothetical protein  39.15 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0340562 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  35.27 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  42.72 
 
 
312 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  42.23 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  33.62 
 
 
308 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  39.41 
 
 
312 aa  123  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  30 
 
 
319 aa  122  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  34.23 
 
 
290 aa  122  9e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  32.75 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  37.23 
 
 
312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  33.99 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  28.52 
 
 
345 aa  116  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  38.56 
 
 
329 aa  115  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  32.82 
 
 
302 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  30.21 
 
 
288 aa  114  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  31.89 
 
 
309 aa  112  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  36.08 
 
 
292 aa  112  9e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  33.67 
 
 
287 aa  112  9e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  36.06 
 
 
292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  30.23 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0457  protein of unknown function DUF58  39.49 
 
 
302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  33.84 
 
 
336 aa  110  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  33.73 
 
 
295 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  34.88 
 
 
324 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  33.82 
 
 
297 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  35.81 
 
 
286 aa  105  7e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  32.13 
 
 
306 aa  102  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  28.19 
 
 
287 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  30.34 
 
 
312 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  29.67 
 
 
331 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  30.35 
 
 
295 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  29.19 
 
 
330 aa  100  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  35.29 
 
 
335 aa  99.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  31.84 
 
 
296 aa  99.8  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  31 
 
 
291 aa  99.4  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  29.19 
 
 
331 aa  99.4  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  31.88 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  33.2 
 
 
340 aa  98.2  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  36.75 
 
 
311 aa  97.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1005  protein of unknown function DUF58  37.6 
 
 
322 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0328767  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  33.17 
 
 
320 aa  96.3  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  33.03 
 
 
340 aa  96.3  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  37.13 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0049  protein of unknown function DUF58  41.18 
 
 
331 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.799483  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2471  protein of unknown function DUF58  33.61 
 
 
319 aa  95.5  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  31.11 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  42.75 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  33.5 
 
 
295 aa  94  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  36.14 
 
 
294 aa  93.2  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  37.5 
 
 
331 aa  92.8  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  31.82 
 
 
334 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  28.18 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0863  hypothetical protein  36.21 
 
 
309 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0448863  normal  0.0441137 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  27.27 
 
 
320 aa  90.5  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  26.74 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1384  hypothetical protein  36.13 
 
 
306 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  36.1 
 
 
309 aa  89.7  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  41.04 
 
 
341 aa  89.7  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  34.3 
 
 
329 aa  89.7  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0822  hypothetical protein  35.66 
 
 
309 aa  89  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.292102 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  26.34 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  28.72 
 
 
276 aa  87.4  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  25.54 
 
 
302 aa  86.7  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  31.19 
 
 
295 aa  85.9  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1735  hypothetical protein  27.13 
 
 
303 aa  85.9  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.548655  normal  0.740515 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  36.1 
 
 
353 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  36.42 
 
 
363 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>