279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0049 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0049  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
331 aa  627  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.799483  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  34.8 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  29 
 
 
303 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  25.28 
 
 
287 aa  123  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  33.98 
 
 
329 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  29 
 
 
303 aa  123  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  31.79 
 
 
295 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  26.74 
 
 
288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  34.94 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  25.09 
 
 
291 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  30.37 
 
 
295 aa  113  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  27.37 
 
 
319 aa  112  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  28.46 
 
 
290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  33.81 
 
 
312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  35.77 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  25.83 
 
 
291 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  26.89 
 
 
287 aa  110  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  29.87 
 
 
287 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  24.84 
 
 
345 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  30.91 
 
 
314 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  33.89 
 
 
292 aa  106  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  30.55 
 
 
314 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  30.18 
 
 
318 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  28.79 
 
 
308 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  31.66 
 
 
312 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  30.18 
 
 
318 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  21.95 
 
 
287 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  29.39 
 
 
308 aa  102  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  32.53 
 
 
335 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  31.4 
 
 
341 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  30.04 
 
 
317 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  29.75 
 
 
302 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  30.04 
 
 
323 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  26.42 
 
 
296 aa  99.8  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  30.46 
 
 
331 aa  99.4  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  26.91 
 
 
292 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  33.33 
 
 
328 aa  96.7  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  29.62 
 
 
296 aa  96.3  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  28.31 
 
 
320 aa  96.3  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  34.26 
 
 
302 aa  96.3  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  35.29 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  33.05 
 
 
314 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  28.3 
 
 
292 aa  94  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  29.22 
 
 
297 aa  94  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  28.46 
 
 
309 aa  93.6  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  33.22 
 
 
363 aa  93.6  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  28.04 
 
 
287 aa  93.2  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  30 
 
 
328 aa  92.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  34.33 
 
 
334 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  36.62 
 
 
317 aa  92  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  33.06 
 
 
393 aa  91.3  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  32.19 
 
 
314 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  28.05 
 
 
296 aa  90.9  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  37.9 
 
 
311 aa  90.1  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  32.55 
 
 
324 aa  90.1  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  32.14 
 
 
418 aa  89.4  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  25.22 
 
 
295 aa  89.4  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  28.15 
 
 
296 aa  89.4  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  37.5 
 
 
324 aa  88.6  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  30.74 
 
 
329 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  28.51 
 
 
322 aa  89  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  28.05 
 
 
295 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  28.78 
 
 
288 aa  88.2  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  37.6 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  32.34 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  32.12 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  32.12 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  38.21 
 
 
317 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  38.21 
 
 
317 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  26.51 
 
 
314 aa  87  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  38.21 
 
 
317 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  38.21 
 
 
317 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  32.85 
 
 
309 aa  86.7  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  35.23 
 
 
311 aa  86.3  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  22.63 
 
 
290 aa  85.9  8e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  32.56 
 
 
306 aa  85.9  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  29.21 
 
 
330 aa  85.9  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  34.02 
 
 
309 aa  85.9  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0185  protein of unknown function DUF58  30.88 
 
 
357 aa  85.5  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  25.6 
 
 
328 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  22.04 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  29.21 
 
 
331 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  29.21 
 
 
331 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  32.22 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  43.69 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  40.17 
 
 
351 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  26.94 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  30.43 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  26.67 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  32.73 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2428  hypothetical protein  41.09 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0340562 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  32.34 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  27.47 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  33.03 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  29.86 
 
 
320 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  25.11 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1005  protein of unknown function DUF58  36.65 
 
 
322 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0328767  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1527  hypothetical protein  37.3 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  32 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0457  protein of unknown function DUF58  36.74 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>