More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2916 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  628  1e-179  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  98.02 
 
 
303 aa  619  1e-176  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  36.82 
 
 
323 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  36.18 
 
 
318 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  36.18 
 
 
314 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  36.18 
 
 
314 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  41.22 
 
 
322 aa  192  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  35.84 
 
 
318 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  36.84 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  37.68 
 
 
309 aa  186  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  34.67 
 
 
317 aa  185  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  37.33 
 
 
393 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  39.78 
 
 
324 aa  178  9e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2601  hypothetical protein  35.67 
 
 
309 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2428  hypothetical protein  39.37 
 
 
309 aa  176  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0340562 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  37.94 
 
 
311 aa  175  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  36.36 
 
 
319 aa  175  9e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  35.8 
 
 
317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  35.8 
 
 
317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  44.16 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  38.25 
 
 
324 aa  172  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  35.9 
 
 
318 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  34.31 
 
 
317 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  35.69 
 
 
317 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  38.5 
 
 
317 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  36.23 
 
 
304 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  34.47 
 
 
314 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  31.58 
 
 
345 aa  169  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  34.81 
 
 
314 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  33.11 
 
 
351 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3091  hypothetical protein  37.89 
 
 
327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  33.21 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1527  hypothetical protein  38.82 
 
 
311 aa  163  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  36.17 
 
 
335 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  35.58 
 
 
312 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1470  hypothetical protein  38.82 
 
 
322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1405  hypothetical protein  38.52 
 
 
322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000755973 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  35.02 
 
 
334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  33.45 
 
 
312 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1458  hypothetical protein  38.52 
 
 
322 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000087198 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  33.45 
 
 
312 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  34.36 
 
 
329 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  34.58 
 
 
341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  32.88 
 
 
316 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  37.66 
 
 
308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  33.84 
 
 
320 aa  152  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  31.1 
 
 
312 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  39.06 
 
 
320 aa  152  8e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  34.3 
 
 
331 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  34.3 
 
 
331 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  33.94 
 
 
330 aa  149  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  33.68 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  34.24 
 
 
312 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  35.42 
 
 
309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  30.15 
 
 
320 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  32.19 
 
 
290 aa  139  7e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  30.98 
 
 
331 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  33.21 
 
 
311 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  33.56 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  32.05 
 
 
287 aa  132  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  31.25 
 
 
288 aa  130  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  34.03 
 
 
287 aa  127  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  32.12 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  30.23 
 
 
309 aa  125  6e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0457  protein of unknown function DUF58  36.99 
 
 
302 aa  125  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  32.25 
 
 
292 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  36.04 
 
 
306 aa  123  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  31.85 
 
 
291 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  29.45 
 
 
295 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  28.78 
 
 
287 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  31.25 
 
 
328 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  31.27 
 
 
328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  28.04 
 
 
302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  28.32 
 
 
340 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.74 
 
 
296 aa  113  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  29.03 
 
 
314 aa  112  5e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  29.73 
 
 
297 aa  112  9e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  29.29 
 
 
296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  30.45 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2471  protein of unknown function DUF58  30.3 
 
 
319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.76 
 
 
292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  27.89 
 
 
296 aa  108  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  26.71 
 
 
329 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  28.4 
 
 
302 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  30.61 
 
 
336 aa  102  9e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0049  protein of unknown function DUF58  39.55 
 
 
331 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.799483  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  35.29 
 
 
286 aa  101  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0863  hypothetical protein  30.83 
 
 
309 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0448863  normal  0.0441137 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  26.76 
 
 
290 aa  100  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  33.09 
 
 
294 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0822  hypothetical protein  31.78 
 
 
309 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.292102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  32.73 
 
 
309 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  32.84 
 
 
294 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  29.25 
 
 
363 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  32.04 
 
 
295 aa  99.8  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  30 
 
 
353 aa  99.8  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1005  protein of unknown function DUF58  34.27 
 
 
322 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0328767  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  26.41 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4307  hypothetical protein  30.53 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0981315 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  27.24 
 
 
287 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>