246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0457 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0457  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 302 aa  580  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0863  hypothetical protein  43.65 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0448863  normal  0.0441137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0822  hypothetical protein  43.65 
 
 		 309 aa  175  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.292102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2471  protein of unknown function DUF58  39.66 
 
 		 319 aa  168  8e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0789  hypothetical protein  44.05 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  0.025632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1005  protein of unknown function DUF58  46.03 
 
 		 322 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0328767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1384  hypothetical protein  45.24 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4307  hypothetical protein  46.85 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0981315 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3276  hypothetical protein  41.31 
 
 		 283 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345093  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  36.99 
 
 		 303 aa  125  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4009  hypothetical protein  43.81 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0352692  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  36.53 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  27.6 
 
 		 319 aa  119  9e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  34.6 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  30.94 
 
 		 310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1126  hypothetical protein  42.58 
 
 		 232 aa  116  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  34 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  34 
 
 		 317 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  34 
 
 		 317 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  33.18 
 
 		 309 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  34 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  34 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  35.59 
 
 		 335 aa  109  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  32.81 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  35 
 
 		 393 aa  105  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  31.09 
 
 		 324 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  33 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  29.96 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  29.55 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  36.61 
 
 		 316 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  23.57 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  24.58 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  31.3 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  35.56 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  31.87 
 
 		 322 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  35.56 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  40.21 
 
 		 334 aa  99  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3091  hypothetical protein  33.5 
 
 		 327 aa  98.2  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  33.14 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  40.38 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  37.07 
 
 		 320 aa  97.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2601  hypothetical protein  33 
 
 		 309 aa  97.1  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1470  hypothetical protein  33 
 
 		 322 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1458  hypothetical protein  33 
 
 		 322 aa  96.3  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000087198 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1405  hypothetical protein  33 
 
 		 322 aa  95.9  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000755973 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2428  hypothetical protein  32.81 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0340562 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  37.59 
 
 		 312 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1527  hypothetical protein  33 
 
 		 311 aa  93.6  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  31 
 
 		 330 aa  92.4  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  31 
 
 		 331 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  30.09 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  30.09 
 
 		 314 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  27.73 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  31 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  30 
 
 		 304 aa  89.4  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  34.13 
 
 		 296 aa  89.4  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  34.38 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  30.34 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  29.81 
 
 		 351 aa  86.7  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  35.16 
 
 		 296 aa  86.7  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  30.77 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  29.03 
 
 		 317 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  33.68 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  33.07 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  29.25 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  31.06 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  32.71 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  28.77 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  33.03 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  36.9 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  29.57 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  28.06 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  28.91 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  28.57 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  30.49 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  31.54 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  31.36 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  30.06 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  34.06 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  31.15 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  37.3 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  34.11 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  35.71 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  30.77 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  26.19 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  32.57 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  27.2 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  31.36 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  28.3 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  29.29 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  30.66 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.92 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  39.6 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  26.98 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  31.58 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  29.29 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  27.2 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  29.58 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  26.19 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>