More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0520 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  652    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  43.08 
 
 
295 aa  255  8e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  38.2 
 
 
287 aa  245  6.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  38.2 
 
 
288 aa  244  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  42.64 
 
 
292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  37.2 
 
 
291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  36.34 
 
 
287 aa  234  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  37.27 
 
 
287 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  39.51 
 
 
290 aa  228  8e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  36.76 
 
 
291 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  38.2 
 
 
296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  39.13 
 
 
296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  38.11 
 
 
309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  36.65 
 
 
292 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  41.45 
 
 
297 aa  210  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  39.51 
 
 
286 aa  211  2e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  36.02 
 
 
302 aa  206  4e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  33.85 
 
 
295 aa  202  8e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  33.55 
 
 
290 aa  196  6e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
296 aa  182  7e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  36.25 
 
 
294 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  35.94 
 
 
294 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  33.11 
 
 
295 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  32.93 
 
 
340 aa  166  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  30.84 
 
 
287 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  28.66 
 
 
296 aa  161  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  31.33 
 
 
295 aa  159  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  29.38 
 
 
329 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  29.5 
 
 
340 aa  155  7e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  32.09 
 
 
363 aa  153  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  31.5 
 
 
328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  31.21 
 
 
295 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  30.63 
 
 
309 aa  146  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  29.5 
 
 
314 aa  144  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  30.96 
 
 
353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  28.43 
 
 
291 aa  135  9e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  30.72 
 
 
310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  32 
 
 
325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  29.25 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  30.7 
 
 
315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  30.7 
 
 
315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  30.7 
 
 
315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  44.68 
 
 
324 aa  126  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  29.1 
 
 
328 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  30.06 
 
 
316 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  30.38 
 
 
302 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  26.07 
 
 
345 aa  122  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  33.68 
 
 
317 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  30.68 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  28.79 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  33.88 
 
 
393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  27.87 
 
 
323 aa  119  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  32.57 
 
 
334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  27.33 
 
 
319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  31.25 
 
 
303 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  31.71 
 
 
317 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  31.13 
 
 
338 aa  116  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  32.75 
 
 
331 aa  116  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  29.03 
 
 
338 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  30.9 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  50 
 
 
309 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  27.69 
 
 
418 aa  112  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  30.2 
 
 
304 aa  112  8.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  26.06 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  29.82 
 
 
350 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  28.88 
 
 
303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  32.23 
 
 
328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  42.14 
 
 
317 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  30.07 
 
 
316 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  47.54 
 
 
317 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  31.49 
 
 
310 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  47.54 
 
 
317 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  47.54 
 
 
317 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  33.04 
 
 
309 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  27.36 
 
 
287 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  47.54 
 
 
317 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  29.2 
 
 
330 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  28.1 
 
 
292 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  29.33 
 
 
331 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  31.21 
 
 
314 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  31.27 
 
 
350 aa  106  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  28.8 
 
 
358 aa  106  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  37.56 
 
 
318 aa  106  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  45.95 
 
 
322 aa  106  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  31.08 
 
 
312 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  29.2 
 
 
331 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  31.91 
 
 
318 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  31.91 
 
 
314 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  30.71 
 
 
302 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  25.85 
 
 
276 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  31.08 
 
 
312 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  31.91 
 
 
318 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  27.79 
 
 
297 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  28.09 
 
 
320 aa  102  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  31.16 
 
 
325 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  30.47 
 
 
335 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  37.32 
 
 
312 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  27.09 
 
 
366 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  48.65 
 
 
351 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  25.17 
 
 
308 aa  99.8  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>