More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1626 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  632  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  87.06 
 
 		 309 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2601  hypothetical protein  78.96 
 
 		 309 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  70.49 
 
 		 317 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  70.49 
 
 		 317 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  70.16 
 
 		 317 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  69.84 
 
 		 317 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  69.84 
 
 		 317 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2428  hypothetical protein  75.4 
 
 		 309 aa  449  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0340562 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3091  hypothetical protein  69.84 
 
 		 327 aa  434  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  68.2 
 
 		 311 aa  435  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1405  hypothetical protein  71.43 
 
 		 322 aa  431  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000755973 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1470  hypothetical protein  71.77 
 
 		 322 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1458  hypothetical protein  71.43 
 
 		 322 aa  431  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000087198 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1527  hypothetical protein  69.08 
 
 		 311 aa  422  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  64.05 
 
 		 318 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  47.64 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  40.56 
 
 		 351 aa  226  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  36.94 
 
 		 324 aa  199  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  41.03 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  36.84 
 
 		 303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  36.84 
 
 		 303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  41.03 
 
 		 317 aa  189  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  36.69 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  39.57 
 
 		 328 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  41.58 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  41.35 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  41.09 
 
 		 318 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  41.09 
 
 		 318 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  40.7 
 
 		 314 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  41.67 
 
 		 314 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  40.66 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  42.41 
 
 		 314 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  41.96 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  41.25 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  40.61 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  44.09 
 
 		 312 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  37.97 
 
 		 393 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  33.99 
 
 		 345 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  40.62 
 
 		 329 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  35.75 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  33.44 
 
 		 312 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  34.05 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  38.79 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  37.39 
 
 		 335 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  32.53 
 
 		 331 aa  135  9e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  33.2 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  32.53 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  32.2 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  38.76 
 
 		 309 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  35.74 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  32.05 
 
 		 331 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  36.32 
 
 		 295 aa  129  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  32.81 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  33.73 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  31.11 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  37.12 
 
 		 306 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  31.97 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0457  protein of unknown function DUF58  34.6 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  33.47 
 
 		 311 aa  115  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  38.15 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  33.33 
 
 		 336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  36.63 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  28.94 
 
 		 297 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  34.52 
 
 		 287 aa  108  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  33.04 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  33.33 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  30.48 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  38.56 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  41.8 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  33.65 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  30.47 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  31.6 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  29.77 
 
 		 340 aa  102  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  34 
 
 		 292 aa  102  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  37.88 
 
 		 287 aa  99.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.72 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  32.38 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2471  protein of unknown function DUF58  34.34 
 
 		 319 aa  97.4  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1005  protein of unknown function DUF58  27.52 
 
 		 322 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0328767  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  30.67 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0863  hypothetical protein  36.55 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0448863  normal  0.0441137 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  31.42 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1384  hypothetical protein  37.91 
 
 		 306 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  30.86 
 
 		 296 aa  90.1  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0822  hypothetical protein  35.92 
 
 		 309 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.292102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  29.21 
 
 		 302 aa  89.4  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  34.27 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  32.57 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0049  protein of unknown function DUF58  41.18 
 
 		 331 aa  86.7  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.799483  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  29.95 
 
 		 290 aa  86.3  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  30.14 
 
 		 353 aa  85.9  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  32.11 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  30.6 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1735  hypothetical protein  32.54 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.548655  normal  0.740515 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  33.33 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  32 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  37.8 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>