More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1479 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  600  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  58.13 
 
 
290 aa  365  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  57.84 
 
 
287 aa  362  4e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  55.4 
 
 
287 aa  348  7e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  55.05 
 
 
288 aa  345  7e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  54.01 
 
 
287 aa  331  9e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  45.89 
 
 
292 aa  298  8e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  45.05 
 
 
295 aa  272  6e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  44.29 
 
 
292 aa  260  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  40.48 
 
 
291 aa  252  6e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  45.35 
 
 
297 aa  249  3e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  40.83 
 
 
296 aa  242  6e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  40.35 
 
 
302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  41.11 
 
 
296 aa  239  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  41.58 
 
 
295 aa  237  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  36.96 
 
 
328 aa  228  8e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  45.49 
 
 
286 aa  225  9e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  40 
 
 
309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  38.3 
 
 
295 aa  219  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  38.24 
 
 
290 aa  218  8.999999999999998e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  37.32 
 
 
287 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  37.85 
 
 
295 aa  215  8e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  40.14 
 
 
296 aa  214  9.999999999999999e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  37.32 
 
 
295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  35.92 
 
 
296 aa  210  3e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  40.7 
 
 
294 aa  209  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  41.05 
 
 
294 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  34.02 
 
 
329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  33.55 
 
 
340 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  35.19 
 
 
363 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  33.22 
 
 
340 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  34.74 
 
 
328 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  31.47 
 
 
309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  30.98 
 
 
314 aa  157  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  31.01 
 
 
353 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  35.71 
 
 
291 aa  151  1e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  32.44 
 
 
287 aa  151  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  30.63 
 
 
276 aa  139  6e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  33.56 
 
 
303 aa  135  9e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  33.89 
 
 
303 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  30.51 
 
 
292 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  28.96 
 
 
314 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  28.62 
 
 
318 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  28.28 
 
 
318 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  30 
 
 
317 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  28.28 
 
 
314 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  27.02 
 
 
325 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  31.73 
 
 
312 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  33.95 
 
 
312 aa  129  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  28.21 
 
 
329 aa  128  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  26.61 
 
 
418 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  29.1 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  29.1 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  27.99 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  27.24 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  30.45 
 
 
328 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  31.37 
 
 
312 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  28.73 
 
 
331 aa  126  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  27.46 
 
 
366 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  29.83 
 
 
314 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  26.64 
 
 
350 aa  122  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  29.07 
 
 
328 aa  122  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  27.39 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  28.76 
 
 
312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  29.51 
 
 
314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  30.09 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  27.73 
 
 
339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  27.54 
 
 
310 aa  116  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  27.02 
 
 
315 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  27.02 
 
 
315 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  27.02 
 
 
315 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  32.76 
 
 
292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  31.5 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  35.1 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  31.48 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  27.35 
 
 
317 aa  112  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  30.59 
 
 
324 aa  112  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  25.17 
 
 
316 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  41.55 
 
 
317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  41.55 
 
 
317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  29.75 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  28.05 
 
 
350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  26.76 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  43.31 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  27.09 
 
 
312 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  27.1 
 
 
302 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  40.85 
 
 
317 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  40.85 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  25.99 
 
 
311 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  28.7 
 
 
309 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  29.13 
 
 
304 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  26.32 
 
 
316 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  37.91 
 
 
318 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  40.14 
 
 
317 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  29.41 
 
 
322 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  28.07 
 
 
302 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  27.17 
 
 
331 aa  106  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  29.39 
 
 
298 aa  106  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  42.62 
 
 
309 aa  105  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  28.16 
 
 
335 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>